RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498454.1

TTYH3-207, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTYH3, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-207ENST00000498454 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.54■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.54■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 PIGSQ96S52 555 aa24.54■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 WBP1LQ9NX94 342 aa24.54■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.54■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.54■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 BCRP11274 1271 aa24.53■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 CCDC174Q6PII3 467 aa24.53■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 C17orf99Q6UX52 265 aa24.53■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 HOMER1Q86YM7 354 aa24.53■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.53■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.53■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.53■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 ERVK-9P63128 1117 aa24.52■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 ERVK-24P63145 666 aa24.52■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.52■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.52■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 CPXCR1Q8N123 301 aa24.52■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 PHKBQ93100 1093 aa24.52■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF536O15090 1300 aa24.52■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 ATP2A1O14983 1001 aa24.51■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 ZBTB5O15062 677 aa24.51■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 CTDNEP1O95476 244 aa24.51■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 OAZ1P54368 228 aa24.51■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 HSCBQ8IWL3 235 aa24.51■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.51■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.51■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 CDKL5O76039 1030 aa24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 STAT3P40763 770 aa24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 PLS1Q14651 629 aa24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 Q3C1V9 767 aa24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 TNS4Q8IZW8 715 aa24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.49■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 PPFIA3O75145 1194 aa24.49■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 ICAM1P05362 532 aa24.49■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 FBXO11Q86XK2 927 aa24.49■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.49■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 DTNBO60941 627 aa24.48■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.48■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.48■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 PNMA2Q9UL42 364 aa24.48■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.48■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 FOXN1O15353 648 aa24.47■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 SLC4A3P48751 1232 aa24.47■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 CCNA1P78396 465 aa24.47■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 AMNQ9BXJ7 453 aa24.47■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 STK36Q9NRP7 1315 aa24.46■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.46■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 GPR25O00155 361 aa24.46■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 JAK2O60674 1132 aa24.46■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 CUL4AQ13619 759 aa24.46■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 USH1GQ495M9 461 aa24.46■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 TSKSQ9UJT2 592 aa24.46■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 RIPK3Q9Y572 518 aa24.46■■□□□ 1.51
TTYH3-207ENST00000498454 SLC25A27O95847 323 aa24.45■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 ALAS1P13196 640 aa24.45■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 PKN1Q16512 942 aa24.45■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 TKFCQ3LXA3 575 aa24.45■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.45■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.45■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 PORCNQ9H237 461 aa24.45■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.45■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 CAPN15O75808 1086 aa24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 DEXIO95424 95 aa24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 SCG2P13521 617 aa24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 COPB2P35606 906 aa24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 SP3Q02447 781 aa24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 TRAF1Q13077 416 aa24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 COA7Q96BR5 231 aa24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 RNF146Q9NTX7 359 aa24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 MGAMO43451 1857 aa24.44■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 ABCB11O95342 1321 aa24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms