RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	DNM1L	O00429	736 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	GNAI3	P08754	354 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	JAG1	P78504	1218 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	LPAR1	Q92633	364 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	GH2	P01242	217 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2C19	P33261	490 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	MCAM	P43121	646 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	NNT	Q13423	1086 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	FOSL2	P15408	326 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP14	P54578	494 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	SHH	Q15465	462 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ST8SIA5	O15466	376 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP5	P45974	858 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	MYLIP	Q8WY64	445 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CNMD	O75829	334 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	GRM5	P41594	1212 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	GRB14	Q14449	540 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF592	Q92610	1267 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	BAD	Q92934	168 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	GNAI2	P04899	355 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	VCAM1	P19320	739 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP7A1	P22680	504 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	MTX1	Q13505	466 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXC6	P09630	235 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CYBA	P13498	195 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ADORA2A	P29274	412 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PLS1	Q14651	629 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SEPT4	O43236	478 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	FSHR	P23945	695 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ZAP70	P43403	619 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.15	□□□□□ -0.3

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