RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495040.1

PLXNA3-208, Transcript of plexin A3, human

TSL 5

Gene PLXNA3, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLXNA3-208	ENST00000495040	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	ACAD9	Q9H845	621 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF536	O15090	1300 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF213	O14771	459 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCDC96	Q2M329	555 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	NT5C2	P49902	561 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	TTC14	Q96N46	770 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	RNF146	Q9NTX7	359 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PLXNA3-208	ENST00000495040	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	ESR2	Q92731	530 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	LAMA4	Q16363	1823 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCDC174	Q6PII3	467 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	RNF180	Q86T96	592 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	MCM3AP	O60318	1980 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	ALAS1	P13196	640 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	PDE4A	P27815	886 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	RTP1	P59025	263 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	POTEB2	H3BUK9	544 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	FGD4	Q96M96	766 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	NEDD4	P46934	1319 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	PGK1	P00558	417 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	SNAP25	P60880	206 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	ACVR2B	Q13705	512 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	PHF24	Q9UPV7	400 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	PDHB	P11177	359 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	SNX17	Q15036	470 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	TTC22	Q5TAA0	569 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	ARMCX2	Q7L311	632 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	FERMT2	Q96AC1	680 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PLXNA3-208	ENST00000495040	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	ICAM1	P05362	532 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	SLC16A2	P36021	539 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	CNTN2	Q02246	1040 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	ADAMTS4	O75173	837 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	IQCA1	Q86XH1	822 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	DGKH	Q86XP1	1220 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	ASB14	A6NK59	587 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	KDM4A	O75164	1064 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	SNHG28	P0DPA3	235 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF543	Q08ER8	600 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	TDH	Q8IZJ6	230 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRIM60	Q495X7	471 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	PNMA2	Q9UL42	364 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	SZT2	Q5T011	3432 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040	RAD50	Q92878	1312 aa		31.26	■■■□□ 2.6
PLXNA3-208	ENST00000495040		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040		A0A1W2PQY0	241 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	NSMF	Q6X4W1	530 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	KRT23	Q9C075	422 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	KATNBL1	Q9H079	304 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	SPC25	Q9HBM1	224 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		31.25	■■■□□ 2.59

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