RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491569.5

ATP6AP1-209, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-209ENST00000491569 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 GINM1Q9NU53 330 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 A0A1B0GVL5 298 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 ESYT2A0FGR8 921 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 POTECB2RU33 542 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 PTPRAP18433 802 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 ADCY7P51828 1080 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 MTMR2Q13614 643 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 INF2Q27J81 1249 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 KIFC2Q96AC6 838 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 PICK1Q9NRD5 415 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 GRIN1Q05586 938 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 SPP2Q13103 211 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 CAMK4Q16566 473 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-209ENST00000491569 USH1GQ495M9 461 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 JMYQ8N9B5 988 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 A0A1W2PQ27 194 aa23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 A0A1W2PQ64 194 aa23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 A0A1W2PQD8 194 aa23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 MCM7P33993 719 aa23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 UBE2SQ16763 222 aa23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF445P59923 1031 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRAPPC10P48553 1259 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 NDUFA8P51970 172 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 SPECC1Q5M775 1068 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 SHC4Q6S5L8 630 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 FBXO11Q86XK2 927 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.352e-9■■■□□ 16.4
ATP6AP1-209ENST00000491569 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 AMNQ9BXJ7 453 aa23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCDC174Q6PII3 467 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 DOCK1Q14185 1865 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 PTPREP23469 700 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 CMA1P23946 247 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 PTGDRQ13258 359 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 CUL5Q93034 780 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 WDR18Q9BV38 432 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 FEM1BQ9UK73 627 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 CUTAO60888 179 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 LPAR1Q92633 364 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 CDCA5Q96FF9 252 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP17L15C9J2P7 530 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP17L11C9JVI0 530 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP17L18D6R9N7 530 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP17L22D6RA61 530 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP17L19D6RCP7 530 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP17L20D6RJB6 530 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 POTEIP0CG38 1075 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 POTEJP0CG39 1038 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 PFKFB1P16118 471 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 VCAM1P19320 739 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 BACE1P56817 501 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP17L24Q0WX57 530 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 FAM160B2Q86V87 743 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 TBCKQ8TEA7 893 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 VGLL4Q14135 290 aa23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 MOB2Q70IA6 237 aa23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1-209ENST00000491569 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.45■■□□□ 1.35
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