RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.9□□□□□ -1.3
PTEN-204ENST00000487939 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTEN-204ENST00000487939 DRC1Q96MC2 740 aa6.9□□□□□ -1.3
PTEN-204ENST00000487939 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.9□□□□□ -1.3
PTEN-204ENST00000487939 ST7Q9NRC1 585 aa6.9□□□□□ -1.3
PTEN-204ENST00000487939 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.9□□□□□ -1.3
PTEN-204ENST00000487939 AKT3Q9Y243 479 aa6.9□□□□□ -1.3
PTEN-204ENST00000487939 AGRPO00253 132 aa6.89□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 HPXP02790 462 aa6.89□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 CD3EP07766 207 aa6.89□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 GSTM1P09488 218 aa6.89□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 AMPD2Q01433 879 aa6.89□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 SV2CQ496J9 727 aa6.89□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 BVESQ8NE79 360 aa6.89□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 MAP6Q96JE9 813 aa6.89□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.89□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.89□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.89□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.89□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 NR0B2Q15466 257 aa6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 LILRA2Q8N149 483 aa6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 NAT16Q8N8M0 369 aa6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 MYLIPQ8WY64 445 aa6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 KIRREL1Q96J84 757 aa6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 RNF114Q9Y508 228 aa6.88□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 SLC14A2Q15849 920 aa6.87□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 RTP2Q5QGT7 225 aa6.87□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.87□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 ASIC4Q96FT7 647 aa6.87□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.87□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 AURKAO14965 403 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 KCNH1O95259 989 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 PAPLNO95428 1278 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 ABHD4Q8TB40 342 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 UBXN4Q92575 508 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.86□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 VAMP4O75379 141 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 IFNGR1P15260 489 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 SNX17Q15036 470 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 KCNMB1Q16558 191 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 ZPBP2Q6X784 338 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 KSR1Q8IVT5 923 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 FAM168AQ92567 244 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.85□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 STXBP3O00186 592 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 TBC1D8O95759 1140 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 ITGAVP06756 1048 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 SEPHS1P49903 392 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 RTP1P59025 263 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 ERVFC1P60507 584 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 SGSM3Q96HU1 749 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 EBF1Q9UH73 591 aa6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTEN-204ENST00000487939 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.83□□□□□ -1.32
PTEN-204ENST00000487939 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTEN-204ENST00000487939 A0A1W2PQY0 241 aa6.83□□□□□ -1.32
PTEN-204ENST00000487939 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.83□□□□□ -1.32
PTEN-204ENST00000487939 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTEN-204ENST00000487939 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.83□□□□□ -1.32
PTEN-204ENST00000487939 PDPK1O15530 556 aa6.83□□□□□ -1.32
PTEN-204ENST00000487939 NRDCO43847 1150 aa6.83□□□□□ -1.32
PTEN-204ENST00000487939 GLI1P08151 1106 aa6.83□□□□□ -1.32
PTEN-204ENST00000487939 SERINC3Q13530 473 aa6.83□□□□□ -1.32
PTEN-204ENST00000487939 RASGRF1Q13972 1273 aa6.83□□□□□ -1.32
PTEN-204ENST00000487939 FYB2Q5VWT5 728 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms