RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PQ27 194 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PQ64 194 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PQC6 194 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PQD8 194 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 NLRX1Q86UT6 975 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 JAMLQ86YT9 394 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNN1Q92952 543 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 WHRNQ9P202 907 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 OR14I1A6ND48 311 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 NOTOA8MTQ0 251 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 CBFA2T2O43439 604 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 PPM1BO75688 479 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 CD3EP07766 207 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 ARL4AP40617 200 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 POU4F1Q01851 419 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 FZD5Q13467 585 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 SHISA4Q96DD7 197 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PQY0 241 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 BTBD11A6QL63 1104 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 EPHX1P07099 455 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 C1QTNF9P0C862 333 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 JAG1P78504 1218 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 RTP2Q5QGT7 225 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 VHLLQ6RSH7 139 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 FGD4Q96M96 766 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A087WZG4 1122 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 EFEMP2O95967 443 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 PNLIPP16233 465 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 PRKCAP17252 672 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 SDHBP21912 280 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 NUP43Q8NFH3 380 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 TOX2Q96NM4 488 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PQJ5 194 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 CASP7P55210 303 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP4F8P98187 520 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-210ENST00000485459 PEX10O60683 326 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D8O95759 1140 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 MPOP05164 745 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 IFNGR1P15260 489 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 GLDCP23378 1020 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 LAPTM5Q13571 262 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 KIR3DS1Q14943 382 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 JMJD8Q96S16 334 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.323e-30■□□□□ 9
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RABGGTB-210ENST00000485459 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 STXBP3O00186 592 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 SEMA7AO75326 666 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 AMPD2Q01433 879 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 NUDT19A8MXV4 375 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 VAMP4O75379 141 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 NAT2P11245 290 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 SEPHS1P49903 392 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 DLG4P78352 724 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 NCAPHQ15003 741 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNA10Q16322 511 aa6.81□□□□□ -1.32
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