RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 ATP7AQ04656 1500 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 LILRA6Q6PI73 481 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ATG4CQ96DT6 458 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC3AO75596 197 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 HPXP02790 462 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 RAP1GAPP47736 663 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 FANCCQ00597 558 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF394Q53GI3 561 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 OXR1Q8N573 874 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 VWCEQ96DN2 955 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 DIRC2Q96SL1 478 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ROCK1Q13464 1354 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRL2O95490 1459 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 KDM5CP41229 1560 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ABCA6Q8N139 1617 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 HFM1A2PYH4 1435 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 KIF3BO15066 747 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 DUSP4Q13115 394 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 RNF34Q969K3 372 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 HDAC8Q9BY41 377 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 FITM1A5D6W6 292 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 CCNFP41002 786 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 MESP2Q0VG99 397 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 GGT6Q6P531 493 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 A2MP01023 1474 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 NCANO14594 1321 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 B8ZZF3 427 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 PRRG2O14669 202 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 TEKQ02763 1124 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 LILRA2Q8N149 483 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A18Q96N87 628 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 RNF32Q9H0A6 362 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 PLXNC1O60486 1568 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ATP10AO60312 1499 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 PRAMEF1O95521 474 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 RECKO95980 971 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 TCTN2Q96GX1 697 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.85□□□□□ -1.31
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