RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D9BQ66K14 1250 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K14Q99558 947 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 SLIT2O94813 1529 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GTH6 734 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF18P17022 549 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00116Q8NCU8 138 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ESR2Q92731 530 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CSRNP2Q9H175 543 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 MMP1P03956 469 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 LIFRP42702 1097 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 GUCY1A3Q02108 690 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC96Q2M329 555 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ODF2Q5BJF6 829 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 MAATS1Q7Z4T9 603 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ARL8AQ96BM9 186 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ABHD10Q9NUJ1 306 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ITGB4P16144 1822 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 BACH1O14867 736 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 MYO1BO43795 1136 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 OPA1O60313 960 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 IFNAR1P17181 557 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 PRDX5P30044 214 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 SEC24CP53992 1094 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF174Q15697 407 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 GUCY2FP51841 1108 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 LRCH2Q5VUJ6 765 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 VEZTQ9HBM0 779 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 MINPP1Q9UNW1 487 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFA10O95299 355 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 KRT14P02533 472 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CD44P16070 742 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 MED15Q96RN5 788 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 E7EVH7 732 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ERCC3P19447 782 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 NEDD9Q14511 834 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 HDAC7Q8WUI4 952 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 NGLY1Q96IV0 654 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 GNPATO15228 680 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 KRT86O43790 486 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 STAG1Q8WVM7 1258 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.482e-6■□□□□ 10.7
CCSAP-204ENST00000483092 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 NUP98P52948 1817 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 GNAT2P19087 354 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 KRT31Q15323 416 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 WASF1Q92558 559 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 DUSP10Q9Y6W6 482 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 MORC3Q14149 939 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ALX1Q15699 326 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 DEXIO95424 95 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 MMP14P50281 582 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 WDR93Q6P2C0 686 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 APBA1Q02410 837 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 CATIPQ7Z7H3 387 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ESYT3A0FGR9 886 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 CPP00450 1065 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 PEX19P40855 299 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP58Q5T655 872 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 IQCEQ6IPM2 695 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 KANK3Q6NY19 840 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 IQCA1Q86XH1 822 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D31Q96DN5 1066 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 EHD2Q9NZN4 543 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 PAPPAQ13219 1627 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 WNT7AO00755 349 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP25P42331 645 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC121Q6ZUS5 278 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 PLIN2Q99541 437 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC1Q9BTT6 524 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 VIPAS39Q9H9C1 493 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms