RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ADCY6O43306 1168 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 AKR1A1P14550 325 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CDK7P50613 346 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 FPGSQ05932 587 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 UBE3CQ15386 1083 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 FGD4Q96M96 766 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 TOX2Q96NM4 488 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.792e-8■■■■□ 21.2
CTPS1-208ENST00000479480 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 STARD7Q9NQZ5 370 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 COG6Q9Y2V7 657 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ZBED9Q6R2W3 1325 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 LTBP2Q14767 1821 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 GSG1L2A8MUP6 293 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 DCDC2CA8MYV0 355 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 F5H6K3 240 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 RAB11FIP3O75154 756 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 TIMP1P01033 207 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 RASA1P20936 1047 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 PBX2P40425 430 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 KLRC3Q07444 240 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CPXCR1Q8N123 301 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF576Q9H609 170 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 GOPCQ9HD26 462 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 TBX21Q9UL17 535 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CNPY2Q9Y2B0 182 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 VCANP13611 3396 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CTAGE5O15320 804 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 NDUFB10O96000 172 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ACRP10323 421 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 PTGS1P23219 599 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 DNAJB2P25686 324 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ACVR2BQ13705 512 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM240Q5SV17 173 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 MFSD5Q6N075 450 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 DDX11Q96FC9 970 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 SLF1Q9BQI6 1058 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 29.9
CTPS1-208ENST00000479480 NYAP2Q9P242 653 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 SMCHD1A6NHR9 2005 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF236Q9UL36 1845 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0G2JMZ2 1700 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM265A0A087WTH1 108 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 MOXD2PA6NHM9 499 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 MINDY4BA8MYZ0 360 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ASGR1P07306 291 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CSF2RAP15509 400 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC144BQ3MJ40 725 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 SBK1Q52WX2 424 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 RASIP1Q5U651 963 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF365Q70YC5 407 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 AMOTL1Q8IY63 956 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 NUP133Q8WUM0 1156 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 PPM1EQ8WY54 764 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 OSBP2Q969R2 916 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 KIFC2Q96AC6 838 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 VTI1AQ96AJ9 217 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 TIFAQ96CG3 184 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 TEX13BQ9BXU2 312 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 PBX4Q9BYU1 374 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 KATNBL1Q9H079 304 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 MKNK2Q9HBH9 465 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ARVCFO00192 962 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ATP2A1O14983 1001 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ZBED4O75132 1171 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 HMMRO75330 724 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 PRDM1O75626 825 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 COPB2P35606 906 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 GJA9P57773 515 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 BEX3Q00994 111 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CNTN2Q02246 1040 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ADGRE1Q14246 886 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 MKL1Q969V6 931 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms