RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 FGFR1P11362 822 aa7.09□□□□□ -1.27
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PRPF40A-208ENST00000472760 USP53Q70EK8 1073 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-208ENST00000472760 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-208ENST00000472760 COPS5Q92905 334 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-208ENST00000472760 FEZ1Q99689 392 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-208ENST00000472760 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-208ENST00000472760 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-208ENST00000472760 PRNPP04156 253 aa7.02□□□□□ -1.29
PRPF40A-208ENST00000472760 CD97P48960 835 aa7.02□□□□□ -1.29
PRPF40A-208ENST00000472760 CYP4F3Q08477 520 aa7.02□□□□□ -1.29
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