RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471215.1

BUD23-215, Transcript of BUD23, rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor, human

TSL 2

Gene BUD23, Length 3,886 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BUD23-215	ENST00000471215	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	TRIM14	Q14142	442 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	PIGS	Q96S52	555 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	GTF2I	P78347	998 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CEP112	Q8N8E3	955 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	PLCG1	P19174	1290 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	RASA1	P20936	1047 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	NEK8	Q86SG6	692 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	MTR	Q99707	1265 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	TBCK	Q8TEA7	893 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215		A0A0U1RQJ8	604 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CYTH3	O43739	400 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	TM4SF1	P30408	202 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	TNNI2	P48788	182 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	DYM	Q7RTS9	669 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215		B4DLN1	442 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	STXBP3	O00186	592 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	ERCC3	P19447	782 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	GPS2	Q13227	327 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	VPS72	Q15906	364 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CEP95	Q96GE4	821 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	UIMC1	Q96RL1	719 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	BICDL2	A1A5D9	508 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CTAGE8	P0CG41	777 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	SV2B	Q7L1I2	683 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	COA7	Q96BR5	231 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	RAB34	Q9BZG1	259 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CDC23	Q9UJX2	597 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	LAD1	O00515	517 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	ERLIN1	O75477	346 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	SERPINB2	P05120	415 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	MCM6	Q14566	821 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	ADSSL1	Q8N142	457 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CHP1	Q99653	195 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	DEF6	Q9H4E7	631 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	TAF1	P21675	1872 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	USP17L5	A8MUK1	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	MB21D1	Q8N884	522 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	RABGGTA	Q92696	567 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	TTC26	A0AVF1	554 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	PPP4C	P60510	307 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CALCRL	Q16602	461 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CERS3	Q8IU89	383 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	TMEM260	Q9NX78	707 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CHD4	Q14839	1912 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	LRP5	O75197	1615 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	DNM2	P50570	870 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BUD23-215	ENST00000471215	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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