RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 PRPHP41219 470 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 NAPAP54920 295 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CTAGE9A4FU28 777 aa20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 ERVK-24P63145 666 aa20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 SLC51AQ86UW1 340 aa20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM47Q96LD4 638 aa20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 EYA3Q99504 573 aa20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 ATP8B1O43520 1251 aa20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 BTDP43251 543 aa20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CHMP4BP1P59074 171 aa20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 SEMA3FQ13275 785 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 TUBB2AQ13885 445 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CEP112Q8N8E3 955 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 AK8Q96MA6 479 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 ST7Q9NRC1 585 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CDC23Q9UJX2 597 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 RHOBTB3O94955 611 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 GNA11P29992 359 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 LETM2Q2VYF4 491 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CUEDC2Q9H467 287 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 C6orf50Q9HD87 102 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.58■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CDK8P49336 464 aa20.58■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 SOGA3Q5TF21 947 aa20.58■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.58■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 TEX11Q8IYF3 940 aa20.58■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 THAP9Q9H5L6 903 aa20.58■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.58■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 OR52Z1P0C646 297 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 CABP7Q86V35 215 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 SLC35F6Q8N357 371 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 CPVLQ9H3G5 476 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 SMCO2A6NFE2 343 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 LGALS16A8MUM7 142 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 KLRC4O43908 158 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 PLA2G4AP47712 749 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 FAM182BQ5T319 152 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 MB21D1Q8N884 522 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 UFL1O94874 794 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 PLCG2P16885 1265 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 PLCG1P19174 1290 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 CD209Q9NNX6 404 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 BTAF1O14981 1849 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PQC6 194 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 TTC26A0AVF1 554 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 TXNRD1Q16881 649 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 NEK8Q86SG6 692 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 EXOC1Q9NV70 894 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 MYH8P13535 1937 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 FAM193AP78312 1265 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 GPSM2P81274 684 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-204ENST00000465425 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms