RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 POTEEQ6S8J3 1075 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 BRF1Q92994 677 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF208Q9H0X6 261 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 TXNRD2Q9NNW7 524 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 PRR12Q9ULL5 1215 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 CNMDO75829 334 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC16A2P36021 539 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 GNAQP50148 359 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 RCAN1P53805 252 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 ERVK-9P63128 1117 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 ERVK-24P63145 666 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 APOA5Q6Q788 366 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 BTBD7Q9P203 1132 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 MAD2L2Q9UI95 211 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 BRPF3Q9ULD4 1205 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 RLFQ13129 1914 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-205ENST00000450873 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 KLRF2D3W0D1 207 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBTB43O43298 467 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 Q3C1V9 767 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 FANCBQ8NB91 859 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 REPS2Q8NFH8 660 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 COA7Q96BR5 231 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 TBC1D32Q96NH3 1257 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 MYL10Q9BUA6 226 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 NEK4P51957 841 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 OAZ1P54368 228 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 EVCP57679 992 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 APOBRQ0VD83 1088 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM132BQ14DG7 1078 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP2R5BQ15173 497 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD1Q15327 319 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 STAG2Q8N3U4 1231 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 IL27Q8NEV9 243 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 LZTS2Q9BRK4 669 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 UBA5Q9GZZ9 404 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATC1LQ9H0A9 340 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 UNC93B1Q9H1C4 597 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 PNMA2Q9UL42 364 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CENPFP49454 3210 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP2A1O14983 1001 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 SMARCA1P28370 1054 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 COPB2P35606 906 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 PLS1Q14651 629 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 MICU3Q86XE3 530 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 KIF2CQ99661 725 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 HTATIP2Q9BUP3 242 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 PARP14Q460N5 1801 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 H0YGN5 161 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 PEX10O60683 326 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 SGPL1O95470 568 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC25A27O95847 323 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 INHAP05111 366 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 MAPK4P31152 587 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 STAT3P40763 770 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 SHCBP1Q8NEM2 672 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA8AA7E2F4 631 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA8BA8MQT2 603 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 ELNP15502 786 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 RXRAP19793 462 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 RABEP1Q15276 862 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 RTN1Q16799 776 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 RIOX2Q8IUF8 465 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGRF4Q8IZF3 695 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 TEX13BQ9BXU2 312 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0G2JMZ2 1700 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CPXCR1Q8N123 301 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CPVLQ9H3G5 476 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 MROH8Q9H579 483 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 RIOX1Q9H6W3 641 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 VAT1LQ9HCJ6 419 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 DOCK3Q8IZD9 2030 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 AK2P54819 239 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 TKFCQ3LXA3 575 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC174Q6PII3 467 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 DPF3Q92784 378 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 SPZ1Q9BXG8 430 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 PORCNQ9H237 461 aa12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158 ms