RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 TEX11Q8IYF3 940 aa18.05■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 TAB2Q9NYJ8 693 aa18.05■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa18.05■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 A0A0U1RQJ8 604 aa18.05■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 MYL1P05976 194 aa18.05■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 ADRA2BP18089 450 aa18.05■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 UBA7P41226 1012 aa18.05■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 NOVP48745 357 aa18.05■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 ATRIPQ8WXE1 791 aa18.05■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 PRDM4Q9UKN5 801 aa18.05■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 H7C1D1 291 aa18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 GGA1Q9UJY5 639 aa18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 USP17L2Q6R6M4 530 aa18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 RHOBTB3O94955 611 aa18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 GYS1P13807 737 aa18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 PLCG2P16885 1265 aa18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 PMS1P54277 932 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 NAPAP54920 295 aa18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 KRT222Q8N1A0 295 aa18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 ABHD10Q9NUJ1 306 aa18.04■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 GAKO14976 1311 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM49BA6NDI0 452 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 SMARCA1P28370 1054 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 SEMA3FQ13275 785 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 KRT25Q7Z3Z0 450 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 CEP95Q96GE4 821 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 LZTFL1Q9NQ48 299 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 ERVK-24P63145 666 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 MFSD14BQ5SR56 506 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 AK8Q96MA6 479 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 POLLQ9UGP5 575 aa18.03■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 SMCO2A6NFE2 343 aa18.02■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 SERPINB2P05120 415 aa18.02■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 TPM1P09493 284 aa18.02■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 PPP2R3AQ06190 1150 aa18.02■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.02■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 RASSF8Q8NHQ8 419 aa18.02■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 PLIN2Q99541 437 aa18.02■□□□□ 0.48
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM14Q14142 442 aa18.02■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 OR52Z1P0C646 297 aa18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 GNA11P29992 359 aa18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 TXNRD1Q16881 649 aa18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 TBC1D16Q8TBP0 767 aa18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 CUEDC2Q9H467 287 aa18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 C6orf50Q9HD87 102 aa18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 FHOD1Q9Y613 1164 aa18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 BBOX1O75936 387 aa18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 ST5P78524 1137 aa18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 LETM2Q2VYF4 491 aa18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 MAGEF1Q9HAY2 307 aa18.01■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 PLCG1P19174 1290 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 UBXN1Q04323 297 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 CABP7Q86V35 215 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 PIGSQ96S52 555 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 UBAP1LF5GYI3 381 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 TTI2Q6NXR4 508 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 NEK8Q86SG6 692 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 CREBRFQ8IUR6 639 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 SLF2Q8IX21 1173 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 ACRBPQ8NEB7 543 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF507Q8TCN5 953 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 RIOX1Q9H6W3 641 aa18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 EPC1Q9H2F5 836 aa17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 THAP9Q9H5L6 903 aa17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 USP17L5A8MUK1 530 aa17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 KIF5CO60282 957 aa17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 KRT9P35527 623 aa17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 CYP26C1Q6V0L0 522 aa17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 MB21D1Q8N884 522 aa17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM9Q9C026 710 aa17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 VAT1LQ9HCJ6 419 aa17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 ESYT2A0FGR8 921 aa17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 LGALS16A8MUM7 142 aa17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 PSMA7O14818 248 aa17.99■□□□□ 0.47
SHQ1-202ENST00000444040 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms