RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429574.1

LIN28AP1-201, Transcript of LIN28A pseudogene 1, humanhuman

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Gene LIN28AP1, Length 405 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AP1-201ENST00000429574 TKFCQ3LXA3 575 aa22.24■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 CCDC174Q6PII3 467 aa22.24■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 DCAF4Q8WV16 495 aa22.24■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.24■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 SPC25Q9HBM1 224 aa22.24■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 POTEB2H3BUK9 544 aa22.23■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 PLA2G6O60733 806 aa22.23■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 PGK1P00558 417 aa22.23■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.23■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 TDHQ8IZJ6 230 aa22.23■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 RNF146Q9NTX7 359 aa22.23■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZMYM6O95789 1325 aa22.23■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.22■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.22■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.22■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.22■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.22■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.22■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 FGRP09769 529 aa22.21■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 ACVR2BQ13705 512 aa22.21■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 ESR2Q92731 530 aa22.21■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.21■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.21■■□□□ 1.15
LIN28AP1-201ENST00000429574 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.2■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 TTC14Q96N46 770 aa22.2■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.2■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 ASB14A6NK59 587 aa22.19■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 SNAP25P60880 206 aa22.19■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 TRIM60Q495X7 471 aa22.19■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 ARMCX2Q7L311 632 aa22.19■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.19■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.19■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.19■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 PHF24Q9UPV7 400 aa22.19■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.18■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 IQCA1Q86XH1 822 aa22.18■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 PNMA2Q9UL42 364 aa22.18■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 SLC16A2P36021 539 aa22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 NT5C2P49902 561 aa22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 NSMFQ6X4W1 530 aa22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 LRCH3Q96II8 777 aa22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.17■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF536O15090 1300 aa22.16■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.16■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 ICAM1P05362 532 aa22.16■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 NOVP48745 357 aa22.16■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 CNTN2Q02246 1040 aa22.16■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.15■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 A0A1W2PQY0 241 aa22.15■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 ACLYP53396 1101 aa22.15■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.15■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.15■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.15■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.15■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.15■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 MCM3APO60318 1980 aa22.15■■□□□ 1.14
LIN28AP1-201ENST00000429574 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 TLE2Q04725 743 aa22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 SNX17Q15036 470 aa22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 KCNA10Q16322 511 aa22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 KAT14Q9H8E8 782 aa22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 ADAMTS4O75173 837 aa22.13■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 CLTBP09497 229 aa22.13■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 PDHBP11177 359 aa22.13■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 TNFAIP2Q03169 654 aa22.13■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.13■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 GNASQ5JWF2 1037 aa22.13■■□□□ 1.13
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