RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.48□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CPVLQ9H3G5 476 aa9.48□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.48□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CEP350Q5VT06 3117 aa9.48□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PEX10O60683 326 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LARGE1O95461 756 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A27O95847 323 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IFNAR1P17181 557 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAPK4P31152 587 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STAT3P40763 770 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SP3Q02447 781 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NTRK3Q16288 839 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q3C1V9 767 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TKFCQ3LXA3 575 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GTF3C6Q969F1 213 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MROH8Q9H579 483 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.47□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTPRFP10586 1907 aa9.46□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYH8P13535 1937 aa9.46□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A0G2JMZ2 1700 aa9.46□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FOXN1O15353 648 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FKTNO75072 461 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDKL5O76039 1030 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNAP25P60880 206 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ST3GAL1Q11201 340 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRAF1Q13077 416 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABRAQ8N0Z2 381 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNX21Q969T3 373 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIGSQ96S52 555 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AMNQ9BXJ7 453 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAF1Q9H063 256 aa9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CPLX1O14810 134 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTDNEP1O95476 244 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNRH1P01148 92 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ERCC3P19447 782 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FCGRTP55899 365 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STK3Q13188 491 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLS1Q14651 629 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC174Q6PII3 467 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CPXCR1Q8N123 301 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHST13Q8NET6 341 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ERO1AQ96HE7 468 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMX3Q96JJ7 454 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PORCNQ9H237 461 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EFCC1Q9HA90 598 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBXO40Q9UH90 709 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TSKSQ9UJT2 592 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RIPK3Q9Y572 518 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABCB11O95342 1321 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STK36Q9NRP7 1315 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STRNO43815 780 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTGFP29279 349 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GHRHRQ02643 423 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIF22Q14807 665 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PKN1Q16512 942 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPR142Q7Z601 462 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBXO11Q86XK2 927 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms