RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 TFR2Q9UP52 801 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 NMT2O60551 498 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 CPP00450 1065 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 CHRNDQ07001 517 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 SPAG1Q07617 926 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 STIM1Q13586 685 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 IQCA1Q86XH1 822 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 COG1Q8WTW3 980 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.55■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 TAF1P21675 1872 aa20.55■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.55■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 PRCPP42785 496 aa20.55■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.55■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC26A0AVF1 554 aa20.54■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS6KA4O75676 772 aa20.54■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.54■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 GUCY2CP25092 1073 aa20.54■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 GYG1P46976 350 aa20.54■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.54■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.54■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 SRGAP2O75044 1071 aa20.53■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 GGCXP38435 758 aa20.53■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRP5P59047 1200 aa20.53■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 NHSQ6T4R5 1651 aa20.53■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.53■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 NARFQ9UHQ1 456 aa20.53■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.52■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 LAMB2P55268 1798 aa20.52■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 CALM1P0DP23 149 aa20.52■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 CALM2P0DP24 149 aa20.52■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 CALM3P0DP25 149 aa20.52■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 HERVK_113P62684 666 aa20.52■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.52■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.52■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.52■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 AGPSO00116 658 aa20.51■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ZMYND10O75800 440 aa20.51■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 SCG2P13521 617 aa20.51■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 DDAH1O94760 285 aa20.51■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.51■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.51■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF384Q8TF68 577 aa20.51■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.51■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 RMND1Q9NWS8 449 aa20.51■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L12C9JPN9 530 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L21D6R901 530 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 STAT6P42226 847 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR59Q6PJI9 974 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 MB21D1Q8N884 522 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 CACNA1SQ13698 1873 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 MYBL2P10244 700 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 DRC1Q96MC2 740 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM107BQ9H098 131 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 KAT14Q9H8E8 782 aa20.5■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 SCN7AQ01118 1682 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 H7C1D1 291 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ZPR1O75312 459 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAPPC10P48553 1259 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ADSSL1Q8N142 457 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC7Q99615 494 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms