RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 TRIM5Q9C035 493 aa21.56■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 BCS1LQ9Y276 419 aa21.56■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 FOXN1O15353 648 aa21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 MMP14P50281 582 aa21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 IL17AQ16552 155 aa21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 FAM83AQ86UY5 434 aa21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 F5H6K3 240 aa21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 KLRC3Q07444 240 aa21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 ISM2Q6H9L7 571 aa21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 NEK8Q86SG6 692 aa21.55■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.54■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 A0A087X0B3 334 aa21.54■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 SLFN14P0C7P3 912 aa21.54■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 ZNF75DP51815 510 aa21.54■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 JAG1P78504 1218 aa21.54■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.54■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 SARM1Q6SZW1 724 aa21.54■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.54■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 SMARCE1Q969G3 411 aa21.54■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 GMCL1Q96IK5 515 aa21.54■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.54■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.54■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 SMTNL1A8MU46 457 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 WNT10BO00744 389 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 TBC1D12O60347 775 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 PRR29P0C7W0 189 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 TXLNAP40222 546 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 PRPHP41219 470 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 TPM4P67936 248 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 LETM2Q2VYF4 491 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 TBCKQ8TEA7 893 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 TMEM260Q9NX78 707 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.53■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.52■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 SMC2O95347 1197 aa21.52■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 NDUFB10O96000 172 aa21.52■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 IQUBQ8NA54 791 aa21.52■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.52■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.52■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.52■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 CUL5Q93034 780 aa21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 TNNI2P48788 182 aa21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 PAGE5Q96GU1 130 aa21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.51■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 IKBKBO14920 756 aa21.5■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 NEMFO60524 1076 aa21.5■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 TPM3P06753 285 aa21.5■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 OR52Z1P0C646 297 aa21.5■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 BMP3P12645 472 aa21.5■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 CLCN1P35523 988 aa21.5■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 SPC24Q8NBT2 197 aa21.5■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 AFMP43652 599 aa21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 E2F4Q16254 413 aa21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 DRC7Q8IY82 874 aa21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 A0A1W2PRG0 241 aa21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 CDC25BP30305 580 aa21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 PTGER2P43116 358 aa21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 ILDR2Q71H61 639 aa21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 SPATA20Q8TB22 786 aa21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 DACH1Q9UI36 760 aa21.49■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 SHTN1A0MZ66 631 aa21.48■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 TMEM232C9JQI7 657 aa21.48■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 MORC3Q14149 939 aa21.48■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.48■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 MLKLQ8NB16 471 aa21.48■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.48■■□□□ 1.03
USP39-202ENST00000409025 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms