RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403258.1

ACTBP8-201, Transcript of actin, beta pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP8, Length 1,108 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP8-201ENST00000403258 PLS1Q14651 629 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 MTMR8Q96EF0 704 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 TRIM47Q96LD4 638 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 UBA5Q9GZZ9 404 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 MROH8Q9H579 483 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 PCNTO95613 3336 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 ERCC3P19447 782 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 HOXD10P28358 340 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 PRMT2P55345 433 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 CAP1Q01518 475 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 RTN1Q16799 776 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 TKFCQ3LXA3 575 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 TMTC3Q6ZXV5 915 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 GPR142Q7Z601 462 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 CPXCR1Q8N123 301 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 COA7Q96BR5 231 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 CPVLQ9H3G5 476 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 JMJD4Q9H9V9 463 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 EFCC1Q9HA90 598 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 CYTH3O43739 400 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 AK2P54819 239 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 RABEP1Q15276 862 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 PLEKHH3Q7Z736 793 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 NBPF11Q86T75 865 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 CHST13Q8NET6 341 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 SOCS4Q8WXH5 440 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 FBXO40Q9UH90 709 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 HPS5Q9UPZ3 1129 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 TRIM17Q9Y577 477 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTBP8-201ENST00000403258 LCTP09848 1927 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 ZBTB5O15062 677 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 STRNO43815 780 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 PLEKHA8P1O95397 391 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 SLC35G1Q2M3R5 365 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 QRICH1Q2TAL8 776 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC174Q6PII3 467 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 NCAPG2Q86XI2 1143 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 ABRAQ8N0Z2 381 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 SRRDQ9UH36 339 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 CCPG1Q9ULG6 757 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 CDC27P30260 824 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 SNAP25P60880 206 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 TRAF1Q13077 416 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 WDR78Q5VTH9 848 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 AGBL1Q96MI9 1066 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 RIPK3Q9Y572 518 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 SLC15A5A6NIM6 579 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 PTPREP23469 700 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 GRB14Q14449 540 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 MORN1Q5T089 497 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 FBXO11Q86XK2 927 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 NUDT12Q9BQG2 462 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 AMNQ9BXJ7 453 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 MAF1Q9H063 256 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 ACAD9Q9H845 621 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 VAT1LQ9HCJ6 419 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 RNF146Q9NTX7 359 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 GJD2Q9UKL4 321 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 ABCB11O95342 1321 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 FCER1AP12319 257 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 ALAS1P13196 640 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 PRKCZQ05513 592 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 FUT2Q10981 343 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 IRF5Q13568 498 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 HOMER1Q86YM7 354 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 TRERF1Q96PN7 1200 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 PIGSQ96S52 555 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 TPCN1Q9ULQ1 816 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 PTPN22Q9Y2R2 807 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 ST18O60284 1047 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 FLT3LGP49771 235 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTBP8-201ENST00000403258 MAP2K5Q13163 448 aa17.66■□□□□ 0.42
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