RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399469.2

HIVEP1-202, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene HIVEP1, Length 2,085 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-202ENST00000399469 CPVLQ9H3G5 476 aa8.56□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.56□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.56□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.56□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 ELP1O95163 1332 aa8.56□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 C19orf81C9J6K1 198 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 STXBP3O00186 592 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 FIBPO43427 364 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 GNA11P29992 359 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 MTMR2Q13614 643 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 MAP3K11Q16584 847 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 ARMC9Q7Z3E5 817 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 BICD2Q8TD16 824 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 RNF39Q9H2S5 420 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 C6orf50Q9HD87 102 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 FEM1BQ9UK73 627 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 TRPM7Q96QT4 1865 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 BTBD18B2RXH4 712 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 KIF28PB7ZC32 967 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC16A2P36021 539 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 BACE1P56817 501 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 PRKG1Q13976 671 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 VGLL4Q14135 290 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 C12orf42Q96LP6 360 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 RRAGCQ9HB90 399 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.55□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 ANKRD62A6NC57 917 aa8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 SPP2Q13103 211 aa8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 BLIDQ8IZY5 108 aa8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 AMNQ9BXJ7 453 aa8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 PNMA2Q9UL42 364 aa8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 FZD1Q9UP38 647 aa8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 A6NJR5 290 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 TRIM75PA6NK02 468 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 YEATS4O95619 227 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 MBD3O95983 291 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 FDX1P10109 184 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 VCAM1P19320 739 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 TRAPPC10P48553 1259 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 FKBP1BP68106 108 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 PPATQ06203 517 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 NPY5RQ15761 445 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 ERO1BQ86YB8 467 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 SHISA4Q96DD7 197 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 LMBRD1Q9NUN5 540 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 SMCO2A6NFE2 343 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 POTEIP0CG38 1075 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 POTEJP0CG39 1038 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 ADCY7P51828 1080 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 NR5A1Q13285 461 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 FBXO11Q86XK2 927 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 OXER1Q8TDS5 423 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 CUL5Q93034 780 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 TNFRSF25Q93038 417 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 USP28Q96RU2 1077 aa8.53□□□□□ -1.04
HIVEP1-202ENST00000399469 SLF1Q9BQI6 1058 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms