RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM132BQ14DG7 1078 aa27.28■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC174Q6PII3 467 aa27.28■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 BTBD7Q9P203 1132 aa27.28■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 RBPJLQ9UBG7 517 aa27.28■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 ZBTB5O15062 677 aa27.27■■□□□ 1.96
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PDSS1-201ENST00000376215 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
PDSS1-201ENST00000376215 ZBED4O75132 1171 aa27.27■■□□□ 1.96
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PDSS1-201ENST00000376215 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 STK36Q9NRP7 1315 aa27.26■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 CPXCR1Q8N123 301 aa27.25■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa27.25■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 RNF186Q9NXI6 227 aa27.25■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 BECN1Q14457 450 aa27.24■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 ATP2A1O14983 1001 aa27.23■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 Q3C1V9 767 aa27.23■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 CPA4Q9UI42 421 aa27.23■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 OAZ1P54368 228 aa27.23■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.23■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 SCG2P13521 617 aa27.22■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 ERVK-9P63128 1117 aa27.22■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 C17orf99Q6UX52 265 aa27.22■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 SPATC1LQ9H0A9 340 aa27.22■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 MORF4L1Q9UBU8 362 aa27.22■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 RIPK3Q9Y572 518 aa27.22■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 WWC2Q6AWC2 1192 aa27.21■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 AMNQ9BXJ7 453 aa27.21■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 CFHR5Q9BXR6 569 aa27.21■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 TEX13BQ9BXU2 312 aa27.21■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 CCPG1Q9ULG6 757 aa27.21■■□□□ 1.95
PDSS1-201ENST00000376215 TBC1D8O95759 1140 aa27.2■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 SLC4A3P48751 1232 aa27.2■■□□□ 1.95
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PDSS1-201ENST00000376215 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
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PDSS1-201ENST00000376215 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa27.19■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.19■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa27.19■■□□□ 1.94
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PDSS1-201ENST00000376215 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.19■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
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PDSS1-201ENST00000376215 BARHL2Q9NY43 387 aa27.18■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 ALAS1P13196 640 aa27.17■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 HOMER2Q9NSB8 354 aa27.17■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 GJB4Q9NTQ9 266 aa27.17■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 ALG1Q9BT22 464 aa27.16■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 PORCNQ9H237 461 aa27.16■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 SAGE1Q9NXZ1 904 aa27.16■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 VPS54Q9P1Q0 977 aa27.16■■□□□ 1.94
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