RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.2■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 H7C1W4 665 aa24.2■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 TACC1O75410 805 aa24.2■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 CARSP49589 748 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
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OPN3-201ENST00000366554 IFFO1Q0D2I5 559 aa24.2■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
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OPN3-201ENST00000366554 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.2■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 IFT20Q8IY31 132 aa24.2■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 KIRREL3Q8IZU9 778 aa24.2■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 FERMT2Q96AC1 680 aa24.2■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
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OPN3-201ENST00000366554 NFU1Q9UMS0 254 aa24.19■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 HYOU1Q9Y4L1 999 aa24.19■■□□□ 1.46
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OPN3-201ENST00000366554 DEXIO95424 95 aa24.19■■□□□ 1.46
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OPN3-201ENST00000366554 FAM205CA6NFA0 338 aa24.18■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 SCTRP47872 440 aa24.18■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 SH2D4AQ9H788 454 aa24.18■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.18■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 CXCR5P32302 372 aa24.18■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 PRCPP42785 496 aa24.18■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 CDK17Q00537 523 aa24.18■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 TAX1BP1Q86VP1 789 aa24.18■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 SLIT3O75094 1523 aa24.18■■□□□ 1.46
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OPN3-201ENST00000366554 CCDC181Q5TID7 509 aa24.17■■□□□ 1.46
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OPN3-201ENST00000366554 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.17■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 NFAT5O94916 1531 aa24.17■■□□□ 1.46
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OPN3-201ENST00000366554 ZBED6P86452 979 aa24.17■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 PAK2Q13177 524 aa24.17■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 BIRC2Q13490 618 aa24.17■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.17■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.17■■□□□ 1.46
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OPN3-201ENST00000366554 TRAPPC3O43617 180 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 RPSAP08865 295 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 LTKP29376 864 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 PAFAH1B1P43034 410 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 RETREG2Q8NC44 543 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 INCENPQ9NQS7 918 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 GDAQ9Y2T3 454 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 QPCTQ16769 361 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 CCDC96Q2M329 555 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.16■■□□□ 1.46
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OPN3-201ENST00000366554 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 C14orf37Q86TY3 774 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 HOOK2Q96ED9 719 aa24.16■■□□□ 1.46
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OPN3-201ENST00000366554 NUP58Q9BVL2 599 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.16■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 TRIM49BA6NDI0 452 aa24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 SARNPP82979 210 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 PI16Q6UXB8 463 aa24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 KLHL33A6NCF5 533 aa24.15■■□□□ 1.46
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