RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ALDH1B1P30837 517 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 RBL2Q08999 1139 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 MNS1Q8NEH6 495 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 CARD6Q9BX69 1037 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 USP40Q9NVE5 1235 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 EFCAB8A8MWE9 144 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 C21orf2O43822 256 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 RAD21O60216 631 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 KIFC2Q96AC6 838 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP95Q96GE4 821 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 DESI2Q9BSY9 194 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 COA1Q9GZY4 146 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 CALML3P27482 149 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP2B2Q01814 1243 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 MTF1Q14872 753 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 BLZF1Q9H2G9 400 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 CYTH3O43739 400 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 DGKHQ86XP1 1220 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKS1AQ92625 1134 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 BLIDQ8IZY5 108 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.981e-8■■■■■ 56
SH3BP1-201ENST00000357436 NT5C2P49902 561 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC175P0C221 793 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 TPM1P09493 284 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 ADGRG1Q9Y653 693 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 MFAP3LO75121 409 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM193AP78312 1265 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 M0R2N6 131 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 AKR1B1P15121 316 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 FECHP22830 423 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC25AP30304 524 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 MYH8P13535 1937 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 GAKO14976 1311 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 GRM4Q14833 912 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT31Q15323 416 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 ECE2O60344 883 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 GYPCP04921 128 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 CASP14P31944 242 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC51Q96ER9 411 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 STK32BQ9NY57 414 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 USP17L5A8MUK1 530 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 COBLO75128 1261 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 PAK1Q13153 545 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 CNGA4Q8IV77 575 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 ST7Q9NRC1 585 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 RMND1Q9NWS8 449 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 SNED1Q8TER0 1413 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 SLX4Q8IY92 1834 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 PLA2G4AP47712 749 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 GNAQP50148 359 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms