RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 BCS1LQ9Y276 419 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 TRIM5Q9C035 493 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 ZNF75DP51815 510 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 ADCY7P51828 1080 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 SPC24Q8NBT2 197 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 MTMR8Q96EF0 704 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 F5H6K3 240 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB5O15062 677 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 KLRC3Q07444 240 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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ACTB-201ENST00000331789 KANK3Q6NY19 840 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.33■□□□□ 0.85
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ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PRG0 241 aa20.33■□□□□ 0.84
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ACTB-201ENST00000331789 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.33■□□□□ 0.84
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
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ACTB-201ENST00000331789 CDC25AP30304 524 aa20.32■□□□□ 0.84
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ACTB-201ENST00000331789 AFMP43652 599 aa20.32■□□□□ 0.84
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ACTB-201ENST00000331789 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 NEK8Q86SG6 692 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 PAGE5Q96GU1 130 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.846e-21■■■□□ 14.8
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ACTB-201ENST00000331789 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 SARM1Q6SZW1 724 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.31■□□□□ 0.84
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ACTB-201ENST00000331789 SMARCE1Q969G3 411 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.31■□□□□ 0.84
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ACTB-201ENST00000331789 UBE2SQ16763 222 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 CASP1P29466 404 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 PRELPP51888 382 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 SNAP25P60880 206 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 NCAPHQ15003 741 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 FAM83AQ86UY5 434 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 GMCL1Q96IK5 515 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.3■□□□□ 0.84
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ACTB-201ENST00000331789 ECE1P42892 770 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 PP2D1A8MPX8 630 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 SMTNL1A8MU46 457 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 LAD1O00515 517 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 EDIL3O43854 480 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 MORC3Q14149 939 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 DRC7Q8IY82 874 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 IQUBQ8NA54 791 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 SPATA20Q8TB22 786 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 ACER1Q8TDN7 264 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 STAMQ92783 540 aa20.29■□□□□ 0.84
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ACTB-201ENST00000331789 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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ACTB-201ENST00000331789 PRPHP41219 470 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 CUL5Q93034 780 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 NEMFO60524 1076 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 OR52Z1P0C646 297 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.27■□□□□ 0.84
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