RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN30Q86W11 494 aa25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 F5H6K3 240 aa25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 WNT10BO00744 389 aa25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 KLRC3Q07444 240 aa25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 MTMR8Q96EF0 704 aa25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB5O15062 677 aa25.89■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 ADCY7P51828 1080 aa25.89■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.89■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 PTGER2P43116 358 aa25.88■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 LETM2Q2VYF4 491 aa25.88■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.88■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 BPIFA3Q9BQP9 254 aa25.88■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM5Q9C035 493 aa25.88■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PRG0 241 aa25.88■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 MYO1BO43795 1136 aa25.88■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFB10O96000 172 aa25.88■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 RASSF7Q02833 373 aa25.88■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.88■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 TBCKQ8TEA7 893 aa25.88■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 TNIP1Q15025 636 aa25.87■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 KANK3Q6NY19 840 aa25.87■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.87■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF75DP51815 510 aa25.86■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 NEK8Q86SG6 692 aa25.86■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 SPC24Q8NBT2 197 aa25.86■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 SLFN14P0C7P3 912 aa25.86■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 CDC25AP30304 524 aa25.86■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 LONP1P36776 959 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.86■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.86■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 FAM83AQ86UY5 434 aa25.86■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 EGFRP00533 1210 aa25.85■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 BMP6P22004 513 aa25.85■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 PRELPP51888 382 aa25.85■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.85■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 GMCL1Q96IK5 515 aa25.85■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 MAN1B1Q9UKM7 699 aa25.85■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 AFMP43652 599 aa25.85■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 SARSP49591 514 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.85■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 NT5DC1Q5TFE4 455 aa25.85■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.85■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 UTRNP46939 3433 aa25.84■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 ECE1P42892 770 aa25.84■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2SQ16763 222 aa25.84■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 SARM1Q6SZW1 724 aa25.84■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.84■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 SMARCE1Q969G3 411 aa25.84■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 PAGE5Q96GU1 130 aa25.84■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.84■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.84■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.83■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 E2F4Q16254 413 aa25.83■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.83■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.83■■□□□ 1.73
VSTM4-201ENST00000298454 LAD1O00515 517 aa25.82■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 CASP1P29466 404 aa25.82■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 SNAP25P60880 206 aa25.82■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 NCAPHQ15003 741 aa25.82■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 ACER1Q8TDN7 264 aa25.82■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 PP2D1A8MPX8 630 aa25.82■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D12O60347 775 aa25.82■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA20Q8TB22 786 aa25.82■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 CUL5Q93034 780 aa25.82■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.81■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM232C9JQI7 657 aa25.81■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 EDIL3O43854 480 aa25.81■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 NEMFO60524 1076 aa25.81■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 BMP3P12645 472 aa25.81■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 PRPHP41219 470 aa25.81■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 IQUBQ8NA54 791 aa25.81■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 OR52Z1P0C646 297 aa25.8■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 STAMQ92783 540 aa25.8■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.8■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.8■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.8■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.8■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 MORC3Q14149 939 aa25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92 ms