RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 APOA5Q6Q788 366 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 GINS2Q9Y248 185 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 BUB1O43683 1085 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 RAB20Q9NX57 234 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 ATP2B4P23634 1241 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 PHBP35232 272 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 GNPTABQ3T906 1256 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 BCAP29Q9UHQ4 241 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 RETREG2Q8NC44 543 aa23.2■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 PFDN4Q9NQP4 134 aa23.2■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.2■■□□□ 1.31
CCSAP-201ENST00000284617 CASP14P31944 242 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNDQ07001 517 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PNMA2Q9UL42 364 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 IFNB1P01574 187 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PALM2Q8IXS6 379 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 BCAS4Q8TDM0 211 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ADCY8P40145 1251 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 AK8Q96MA6 479 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 NOD1Q9Y239 953 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 SH3BP5O60239 455 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2MP0CAP2 368 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 SARNPP82979 210 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO11Q86XK2 927 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 NUF2Q9BZD4 464 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA3EO15041 775 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 HADHQ16836 314 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CTAGE3PQ8IX95 158 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 BBOF1Q8ND07 529 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 MGARPQ8TDB4 240 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PHKA1P46020 1223 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 NSMCE1Q8WV22 266 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 KRT12Q99456 494 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PDE6CP51160 858 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 AOC3Q16853 763 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 HAUS2Q9NVX0 235 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R5DQ14738 602 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 K7ENM7 598 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PPARDQ03181 441 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 DPCR1Q3MIW9 517 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 MIPOL1Q8TD10 442 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 RILPQ96NA2 401 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 GREM2Q9H772 168 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ZWINTO95229 277 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN7Q9Y6W3 813 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 DPH5Q9H2P9 285 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 LIG4P49917 911 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 SYNMO15061 1565 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 SLC12A2P55011 1212 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms