RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.66□□□□□ -1.02
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USP3-201ENST00000268049 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.66□□□□□ -1.02
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USP3-201ENST00000268049 CCDC102BQ68D86 513 aa8.65□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.65□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 VCXQ9H320 206 aa8.65□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 ARHGAP25P42331 645 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 NT5C2P49902 561 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 UBE2HP62256 183 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 SKAP1Q86WV1 359 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 FAM167AQ96KS9 214 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 TEKT3Q9BXF9 490 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.64□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.64□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 VEPH1Q14D04 833 aa8.64□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.64□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 ARMT1Q9H993 441 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 H7C1W4 665 aa8.64□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 DNA2P51530 1060 aa8.64□□□□□ -1.03
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