RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251303.10

SLX1A-201, Transcript of SLX1 homolog A, structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLX1A, Length 1,091 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1A-201ENST00000251303 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.71■■□□□ 1.23
SLX1A-201ENST00000251303 FBXO40Q9UH90 709 aa22.71■■□□□ 1.23
SLX1A-201ENST00000251303 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SLX1A-201ENST00000251303 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 CTAGE5O15320 804 aa22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 OAZ1P54368 228 aa22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 NKX3-2P78367 333 aa22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 GNASQ5JWF2 1037 aa22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 TMEM199Q8N511 208 aa22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 CHST13Q8NET6 341 aa22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 MKL1Q969V6 931 aa22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 FEM1BQ9UK73 627 aa22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.7■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.69■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.69■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 OSBP2Q969R2 916 aa22.69■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.69■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 CEP95Q96GE4 821 aa22.69■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.69■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.68■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF365Q70YC5 407 aa22.68■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.68■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.68■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 APPBP2Q92624 585 aa22.68■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.68■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.68■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.67■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 CD4P01730 458 aa22.67■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 ACRP10323 421 aa22.67■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.67■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 TNFRSF10AO00220 468 aa22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 PRDM1O75626 825 aa22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 TTLL1O95922 423 aa22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 CNTN2Q02246 1040 aa22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 IL23AQ9NPF7 189 aa22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.66■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 ASTN1O14525 1302 aa22.65■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 GBF1Q92538 1859 aa22.65■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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SLX1A-201ENST00000251303 CYP2C18P33260 490 aa22.65■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 TDO2P48775 406 aa22.65■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 BEX3Q00994 111 aa22.65■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 HERVK_113Q902F9 699 aa22.65■■□□□ 1.22
SLX1A-201ENST00000251303 ACAD9Q9H845 621 aa22.65■■□□□ 1.22
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SLX1A-201ENST00000251303 FDX1P10109 184 aa22.64■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 BMP3P12645 472 aa22.64■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 GNAT2P19087 354 aa22.64■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 TNFAIP2Q03169 654 aa22.64■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 RAB30Q15771 203 aa22.64■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 SLFN13Q68D06 897 aa22.64■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 M0R2C6 588 aa22.63■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 ADGRE1Q14246 886 aa22.63■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.63■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 PPM1EQ8WY54 764 aa22.63■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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SLX1A-201ENST00000251303 THEGQ9P2T0 379 aa22.63■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF536O15090 1300 aa22.62■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.62■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 TMEM232C9JQI7 657 aa22.62■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 CABYRO75952 493 aa22.62■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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SLX1A-201ENST00000251303 TLK2Q86UE8 772 aa22.62■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.62■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 HIPK3Q9H422 1215 aa22.62■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 RNF146Q9NTX7 359 aa22.62■■□□□ 1.21
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SLX1A-201ENST00000251303 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.61■■□□□ 1.21
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SLX1A-201ENST00000251303 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.61■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 GRIN2DO15399 1336 aa22.6■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 FGBP02675 491 aa22.6■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 APPP05067 770 aa22.6■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 TSPY3P0CV98 308 aa22.6■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 TSPY8P0CW00 308 aa22.6■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 ITGA7Q13683 1181 aa22.6■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SLX1A-201ENST00000251303 TKFCQ3LXA3 575 aa22.6■■□□□ 1.21
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