RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1W2PQY0 241 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 POTEB2H3BUK9 544 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 NMT2O60551 498 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 KCTD1Q719H9 257 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 Q7L0L9 218 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 BADQ92934 168 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 FAM227BQ96M60 508 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 LNPKQ9C0E8 428 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 SPC25Q9HBM1 224 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF536O15090 1300 aa24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 NOVP48745 357 aa24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 ACLYP53396 1101 aa24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 ARMCX2Q7L311 632 aa24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 TOMM22Q9NS69 142 aa24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 RNF146Q9NTX7 359 aa24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-201ENST00000250495 A0A0D9SFI3 127 aa24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 CLTBP09497 229 aa24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 KCNA10Q16322 511 aa24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 DCAF4Q8WV16 495 aa24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 FGD4Q96M96 766 aa24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 LTBP2Q14767 1821 aa24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 ALAS1P13196 640 aa24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 CNTN2Q02246 1040 aa24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 SMC5Q8IY18 1101 aa24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 RILPL2Q969X0 211 aa24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 TOX2Q96NM4 488 aa24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
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NEDD8-201ENST00000250495 ASB14A6NK59 587 aa24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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NEDD8-201ENST00000250495 SHHQ15465 462 aa24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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NEDD8-201ENST00000250495 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 MTMR7Q9Y216 660 aa24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 ZMYM6O95789 1325 aa24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA0355O15063 1070 aa24.85■■□□□ 1.57
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NEDD8-201ENST00000250495 RAG1P15918 1043 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 GJA9P57773 515 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC96Q2M329 555 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 ELP1O95163 1332 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.84■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.84■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 SNAP25P60880 206 aa24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 GNASQ5JWF2 1037 aa24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 TTC14Q96N46 770 aa24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 KATNBL1Q9H079 304 aa24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-201ENST00000250495 MYADML2A6NDP7 307 aa24.82■■□□□ 1.56
NEDD8-201ENST00000250495 ICAM1P05362 532 aa24.82■■□□□ 1.56
NEDD8-201ENST00000250495 ASGR1P07306 291 aa24.82■■□□□ 1.56
NEDD8-201ENST00000250495 SDSP20132 328 aa24.82■■□□□ 1.56
NEDD8-201ENST00000250495 TNFAIP2Q03169 654 aa24.82■■□□□ 1.56
NEDD8-201ENST00000250495 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.82■■□□□ 1.56
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