RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 HOXC6P09630 235 aa20.39■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 ERCC3P19447 782 aa20.39■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.39■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 INCENPQ9NQS7 918 aa20.39■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 TSPY2A6NKD2 308 aa20.38■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 VWA5AO00534 786 aa20.38■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 COL9A1P20849 921 aa20.38■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.38■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 CCL14Q16627 93 aa20.38■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.38■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.38■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGAP33O14559 1287 aa20.37■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC25A27O95847 323 aa20.37■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.37■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.37■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.37■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 TTC22Q5TAA0 569 aa20.36■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.36■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.36■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 REPS2Q8NFH8 660 aa20.36■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.36■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 ADORA2AP29274 412 aa20.35■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 STAT3P40763 770 aa20.35■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.35■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 SLFN13Q68D06 897 aa20.35■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 DPP9Q86TI2 863 aa20.35■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.35■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.35■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 STX8Q9UNK0 236 aa20.35■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 FCER1AP12319 257 aa20.34■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 BMP3P12645 472 aa20.34■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 COPB2P35606 906 aa20.34■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 HAND2P61296 217 aa20.34■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.34■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 TOMM22Q9NS69 142 aa20.34■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.34■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.34■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 FEM1BQ9UK73 627 aa20.34■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 NMT2O60551 498 aa20.33■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 NOVP48745 357 aa20.33■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.33■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.33■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.33■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 GMCL1Q96IK5 515 aa20.33■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.33■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 NBPF3Q9H094 633 aa20.33■□□□□ 0.85
PLGRKT-201ENST00000223864 ATP2A1O14983 1001 aa20.32■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 COBLO75128 1261 aa20.32■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 ZBED4O75132 1171 aa20.32■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 IGHA2P01877 340 aa20.32■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 PBX2P40425 430 aa20.32■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.32■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.32■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.32■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.32■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF213O14771 459 aa20.31■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC1A4P43007 532 aa20.31■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 KIFC2Q96AC6 838 aa20.31■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.31■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.31■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.31■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 ALPK3Q96L96 1907 aa20.31■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM232C9JQI7 657 aa20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 MAP3K7O43318 606 aa20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 FDX1P10109 184 aa20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 MCCP23508 829 aa20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 KCTD2Q14681 263 aa20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 MMP19Q99542 508 aa20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.3■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 PLA2G6O60733 806 aa20.29■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 CYP2C19P33261 490 aa20.29■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 NT5C2P49902 561 aa20.29■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 STAT2P52630 851 aa20.29■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 OAZ1P54368 228 aa20.29■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM160B2Q86V87 743 aa20.29■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 CPXCR1Q8N123 301 aa20.29■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms