RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 ADCY7P51828 1080 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 FERMT2Q96AC1 680 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 TMX2Q9Y320 296 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 TMEM232C9JQI7 657 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 TIGD1Q96MW7 591 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 GOPCQ9HD26 462 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 TMEM260Q9NX78 707 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC25A3-201ENST00000188376 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 ASNSP08243 561 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 USP49Q70CQ1 688 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 SNAP25P60880 206 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 EPS15P42566 896 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 LONRF3Q496Y0 759 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 TBCKQ8TEA7 893 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 EPSTI1Q96J88 318 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 A0A087WWV3 80 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 LETM2Q2VYF4 491 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 PDILTQ8N807 584 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 CNNM3Q8NE01 707 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 CUL5Q93034 780 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 VCPKMTQ9H867 229 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 RNF181Q9P0P0 153 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 IL17AQ16552 155 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 STX1AQ16623 288 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 UBE2SQ16763 222 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 UVSSAQ2YD98 709 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 NEK8Q86SG6 692 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 SH2D4AQ9H788 454 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 STAT2P52630 851 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 GGA3Q9NZ52 723 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 AMNQ9BXJ7 453 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC25A3-201ENST00000188376 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF165P49910 485 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 PNOCQ13519 176 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 USH1GQ495M9 461 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 LUZP1Q86V48 1076 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 FBXO11Q86XK2 927 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 FEZ1Q99689 392 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 CBX8Q9HC52 389 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 A0A087X0B3 334 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 INPP5BP32019 993 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 ANO10Q9NW15 660 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 FOXN1O15353 648 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 USP17L15C9J2P7 530 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 USP17L11C9JVI0 530 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 USP17L18D6R9N7 530 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC25A3-201ENST00000188376 USP17L22D6RA61 530 aa21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms