RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 P4HA1P13674 534 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 NPR1P16066 1061 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PTGDRQ13258 359 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 DEPTORQ8TB45 409 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNJ18B7U540 433 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 M0QZ92 97 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 MORC3Q14149 939 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNJ12Q14500 433 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 IFNAR1P17181 557 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 GLG1Q92896 1179 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 USP14P54578 494 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 SULF1Q8IWU6 871 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 GSDMAQ96QA5 445 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 SPATA1Q5VX52 437 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 SUSD4Q5VX71 490 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 OSBP2Q969R2 916 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 GAS8O95995 478 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 IFT20Q8IY31 132 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 COA1Q9GZY4 146 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 ADRA2BP18089 450 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF365Q70YC5 407 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 PANK4Q9NVE7 773 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 NBPF11Q86T75 865 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 CSRNP1Q96S65 589 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 SPC25Q9HBM1 224 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 MYL1P05976 194 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 STAT1P42224 750 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 LCORLQ8N3X6 602 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 A6NNZ2 444 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC93Q567U6 631 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 RRAGAQ7L523 313 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC25Q86WR0 208 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 NECTIN1Q15223 517 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 NARFQ9UHQ1 456 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 CLIC4Q9Y696 253 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 ALDH3A1P30838 453 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 RPS6KA1Q15418 735 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 NDUFA8P51970 172 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 TERF1P54274 439 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 PPM1EQ8WY54 764 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 IGKV5-2P06315 115 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 TNNI1P19237 187 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.6 ms