RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637919.1

PLCB1-233, Transcript of phospholipase C beta 1, human

TSL 5 BASIC

Gene PLCB1, Length 5,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLCB1-233	ENST00000637919	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PPP1R2	P41236	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	LMNB2	Q03252	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	POLA2	Q14181	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	3e-6	■■■■■ 50.8
PLCB1-233	ENST00000637919	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	C5	P01031	1676 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	LRP5	O75197	1615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SCP2	P22307	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NLRP5	P59047	1200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	6e-7	■■■□□ 15.2
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NR1D1	P20393	614 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MXRA7	P84157	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NCOA7	Q8NI08	942 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SKOR1	P84550	965 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NLRP14	Q86W24	1093 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MFAP3L	O75121	409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SMIM24	O75264	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PEX19	P40855	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	KIFC2	Q96AC6	838 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	EYA3	Q99504	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ADCY9	O60503	1353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	KRT9	P35527	623 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PCK1	P35558	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ITIH3	Q06033	890 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	BIRC3	Q13489	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms