RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631199.2

CNTNAP2-208, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 3

Gene CNTNAP2, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-208	ENST00000631199	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	FOSL2	P15408	326 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	EVX2	Q03828	476 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CTR9	Q6PD62	1173 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KIFC2	Q96AC6	838 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	FBXO40	Q9UH90	709 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PHF24	Q9UPV7	400 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199		F5H6K3	240 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TSPY3	P0CV98	308 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TSPY8	P0CW00	308 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PDE4B	Q07343	736 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KLRC3	Q07444	240 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SNX17	Q15036	470 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MIER1	Q8N108	512 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GUCD1	Q96NT3	240 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	FEM1B	Q9UK73	627 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ERC2	O15083	957 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZEB2	O60315	1214 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TTLL1	O95922	423 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ACLY	P53396	1101 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TMEM199	Q8N511	208 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	IL27	Q8NEV9	243 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	APPBP2	Q92624	585 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NAPB	Q9H115	298 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NYAP2	Q9P242	653 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		9.02	□□□□□ -0.96
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KIAA0355	O15063	1070 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NDUFB10	O96000	172 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	FDX1	P10109	184 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	BMP3	P12645	472 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	STAT2	P52630	851 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ACVR2B	Q13705	512 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KCNA10	Q16322	511 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SBK1	Q52WX2	424 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CHST13	Q8NET6	341 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MYLIP	Q8WY64	445 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TOX2	Q96NM4	488 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ELP1	O95163	1332 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GPAA1	O43292	621 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PRDM1	O75626	825 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TIMP1	P01033	207 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	IGHA2	P01877	340 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RASA1	P20936	1047 aa		9.01	□□□□□ -0.97

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