RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-215	ENST00000628018	ELP1	O95163	1332 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	NR5A1	Q13285	461 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	USP17L10	C9JJH3	530 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	CALML3	P27482	149 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	28.64	■■■□□ 2.18	8e-20	■■□□□ 14.3
CAPNS1-215	ENST00000628018	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CAPNS1-215	ENST00000628018	TMEM232	C9JQI7	657 aa		28.64	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	SPATA32	Q96LK8	384 aa		28.64	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	WDR18	Q9BV38	432 aa		28.64	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZBTB5	O15062	677 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	PTPRA	P18433	802 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	GALNT17	Q6IS24	598 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	TNFRSF25	Q93038	417 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	28.63	■■■□□ 2.17	1e-7	■■■□□ 14.8
CAPNS1-215	ENST00000628018	PICK1	Q9NRD5	415 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	CDCA5	Q96FF9	252 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	FEZ1	Q99689	392 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	NAPA	P54920	295 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	PLA2G6	O60733	806 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	PRKG1	Q13976	671 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	BLID	Q8IZY5	108 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	LPAR1	Q92633	364 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	STAT2	P52630	851 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	GPT2	Q8TD30	523 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	CLIC4	Q9Y696	253 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	ESYT2	A0FGR8	921 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018		M0R2N6	131 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	ADAMTS3	O15072	1205 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	UBE2H	P62256	183 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAP3K9	P80192	1104 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	YEATS4	O95619	227 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	SPP2	Q13103	211 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	ANO1	Q5XXA6	986 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	COA7	Q96BR5	231 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CAPNS1-215	ENST00000628018	SMCO2	A6NFE2	343 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	NF2	P35240	595 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	USP14	P54578	494 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	MTMR2	Q13614	643 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	OTOF	Q9HC10	1997 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	C6orf50	Q9HD87	102 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	MBD3	O95983	291 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	POTEI	P0CG38	1075 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	POTEJ	P0CG39	1038 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	GNA11	P29992	359 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	BACE1	P56817	501 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	FAM160B2	Q86V87	743 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	FEM1B	Q9UK73	627 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	FAM205C	A6NFA0	338 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	VGLL4	Q14135	290 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	RRAGC	Q9HB90	399 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CAPNS1-215	ENST00000628018	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16

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