RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 YEATS4O95619 227 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 BMP3P12645 472 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 INPP5BP32019 993 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 JMJD4Q9H9V9 463 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 VAT1LQ9HCJ6 419 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 LOC285556D6RIA3 1793 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 SLC16A2P36021 539 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 NAPAP54920 295 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 ANO1Q5XXA6 986 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 GALNT17Q6IS24 598 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 SULF1Q8IWU6 871 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 PCDHA4Q9UN74 947 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 IQCA1LA6NCM1 817 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 USP17L10C9JJH3 530 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 ADM5C9JUS6 153 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 STK38Q15208 465 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 RILPL1Q5EBL4 403 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 BLIDQ8IZY5 108 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 LINC00301Q8NCQ3 95 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 WRNIP1Q96S55 665 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 FEZ1Q99689 392 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 CLIC4Q9Y696 253 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 FAM205CA6NFA0 338 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 M0R2N6 131 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 ZBTB5O15062 677 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 KCNG4Q8TDN1 519 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 KLRG1Q96E93 195 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 PGBD1Q96JS3 809 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM232C9JQI7 657 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 ADAMTS3O15072 1205 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 PTPAQ15257 358 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 QRICH1Q2TAL8 776 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 KRT26Q7Z3Y9 468 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 WDR18Q9BV38 432 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 POTECB2RU33 542 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 SPTLC2O15270 562 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 PLA2G6O60733 806 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 GNA11P29992 359 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 STAT2P52630 851 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 SLC39A14Q15043 492 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 LPAR1Q92633 364 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 AS3MTQ9HBK9 375 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 C6orf50Q9HD87 102 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 PICK1Q9NRD5 415 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 FZD1Q9UP38 647 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-227ENST00000598960 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 SMCO2A6NFE2 343 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 PTPRAP18433 802 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 TRAPPC10P48553 1259 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 ADCY7P51828 1080 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 FAM160B2Q86V87 743 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 RASGRP4Q8TDF6 673 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 COA7Q96BR5 231 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 CDCA5Q96FF9 252 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM63CQ9P1W3 806 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 PRR12Q9ULL5 1215 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 TRPM7Q96QT4 1865 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-227ENST00000598960 A0A0G2JMZ2 1700 aa16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms