RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-223ENST00000592576 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 JMJD4Q9H9V9 463 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 GJB4Q9NTQ9 266 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 SYT1P21579 422 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 BTNL9Q6UXG8 535 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 WNK4Q96J92 1243 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 PIGSQ96S52 555 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 PTPRFP10586 1907 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 KIFC2Q96AC6 838 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 ALG1Q9BT22 464 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 PRR12Q9ULL5 1215 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 KIF3AQ9Y496 699 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 TMEM88BA6NKF7 163 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 TREML2Q5T2D2 321 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 GADL1Q6ZQY3 521 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 CHURC1Q8WUH1 139 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 FEM1BQ9UK73 627 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 FLOT1O75955 427 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 SCG2P13521 617 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 PDCP20941 246 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 SNAP25P60880 206 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 SNAPC2Q13487 334 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 SPRYD7Q5W111 196 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 PLA2G6O60733 806 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 GUCY1B3Q02153 619 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 WASF1Q92558 559 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 MTMR8Q96EF0 704 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 C8orf76Q96K31 380 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 STX6O43752 255 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 MOGSQ13724 837 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 RGMBQ6NW40 437 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM160B2Q86V87 743 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 SLF1Q9BQI6 1058 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-223ENST00000592576 MYH6P13533 1939 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 SHISA4Q96DD7 197 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 VPS54Q9P1Q0 977 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 H3BQV1 296 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 ZBTB5O15062 677 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 QRICH1Q2TAL8 776 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 IFFO2Q5TF58 517 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 RASAL3Q86YV0 1011 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 USP17L15C9J2P7 530 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 USP17L11C9JVI0 530 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 USP17L18D6R9N7 530 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 USP17L22D6RA61 530 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 USP17L19D6RCP7 530 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 USP17L20D6RJB6 530 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 GTF2A2P52657 109 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 USP17L24Q0WX57 530 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 WWC2Q6AWC2 1192 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 TYW1BQ6NUM6 668 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 CHMP5Q9NZZ3 219 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 COG2Q14746 738 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 KCNJ14Q9UNX9 436 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 MTMR6Q9Y217 621 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 ZDHHC9Q9Y397 364 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 CETPP11597 493 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 CCL15Q16663 113 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 KRT40Q6A162 431 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 BRI3BPQ8WY22 251 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 ATG4CQ96DT6 458 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 BARHL2Q9NY43 387 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 NUCB2P80303 420 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 TRIM29Q14134 588 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 GPAT2Q6NUI2 795 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-223ENST00000592576 CCDC174Q6PII3 467 aa10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.4 ms