RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	RASA1	P20936	1047 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	PRDM1	O75626	825 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	GNAT2	P19087	354 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	APPBP2	Q92624	585 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	GPAA1	O43292	621 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	ACLY	P53396	1101 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	FPGS	Q05932	587 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	SPC25	Q9HBM1	224 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326		A0A0G2JMZ2	1700 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP36-223	ENST00000592326	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ITGB8	P26012	769 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ACVR2B	Q13705	512 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	KCNA10	Q16322	511 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	MYLIP	Q8WY64	445 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326		M0R2C6	588 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	TTLL1	O95922	423 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	BMP3	P12645	472 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	FOSL2	P15408	326 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	PDE4B	Q07343	736 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	CEP95	Q96GE4	821 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	RLF	Q13129	1914 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	MYH8	P13535	1937 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	TMEM232	C9JQI7	657 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	EPHB4	P54760	987 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	TFAP4	Q01664	338 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	FAAP100	Q0VG06	881 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	TOX2	Q96NM4	488 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	NAPB	Q9H115	298 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP36-223	ENST00000592326	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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