RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590096.1

ATG4D-212, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 1,282 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-212ENST00000590096 PORCNQ9H237 461 aa24.93■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.93■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 SRRDQ9UH36 339 aa24.93■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF543Q08ER8 600 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 WDR78Q5VTH9 848 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 TMTC2Q8N394 836 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 PSMA5P28066 241 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 STAT3P40763 770 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 REPS2Q8NFH8 660 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 LY9Q9HBG7 655 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 CCDC69A6NI79 296 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 SLC25A27O95847 323 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 SLC16A2P36021 539 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 PRKCZQ05513 592 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 GPR142Q7Z601 462 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 CPXCR1Q8N123 301 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 RAET1EQ8TD07 263 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 SENP2Q9HC62 589 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4D-212ENST00000590096 ERCC3P19447 782 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 COPB2P35606 906 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 LIFRP42702 1097 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 OAZ1P54368 228 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 MROH8Q9H579 483 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 ATP2A1O14983 1001 aa24.87■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 FLT3LGP49771 235 aa24.87■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 C8orf34Q49A92 452 aa24.87■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.87■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 GABRQQ9UN88 632 aa24.87■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 SLC4A3P48751 1232 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 FGD1P98174 961 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 DDAH1O94760 285 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 TROAPQ12815 778 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 GRM4Q14833 912 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 CCDC174Q6PII3 467 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 PTPREP23469 700 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 RGS19P49795 217 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 SNAP25P60880 206 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 GJD2Q9UKL4 321 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 PLXNB2O15031 1838 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 STRNO43815 780 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 SEC24BO95487 1268 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 CPA1P15085 419 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 RPS6KB1P23443 525 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 IRF5Q13568 498 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 MAP3K14Q99558 947 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4D-212ENST00000590096 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ATG4D-212ENST00000590096 KLRF2D3W0D1 207 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4D-212ENST00000590096 CALM1P0DP23 149 aa24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms