RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 USP17L10C9JJH3 530 aa29.96■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa29.96■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 TNFRSF25Q93038 417 aa29.96■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 hCG_1984214I3L0E3 225 aa29.95■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 NLRP5P59047 1200 aa29.95■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATA32Q96LK8 384 aa29.95■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa29.95■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 CALML3P27482 149 aa29.95■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC148Q8NFR7 591 aa29.95■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.95■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 PHIPQ8WWQ0 1821 aa29.94■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM232C9JQI7 657 aa29.94■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 ADAMTS3O15072 1205 aa29.94■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPRAP18433 802 aa29.94■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 BRMS1Q9HCU9 246 aa29.94■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 RTEL1Q9NZ71 1219 aa29.94■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 RCOR1Q9UKL0 485 aa29.94■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB5O15062 677 aa29.93■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.93■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 GPT2Q8TD30 523 aa29.93■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR18Q9BV38 432 aa29.93■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 POLR3EQ9NVU0 708 aa29.93■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 DAGLBQ8NCG7 672 aa29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 CDCA5Q96FF9 252 aa29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 FEZ1Q99689 392 aa29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 ZMYND12Q9H0C1 365 aa29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 PICK1Q9NRD5 415 aa29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHA4Q9UN74 947 aa29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 OTOFQ9HC10 1997 aa29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 NASPP49321 788 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 NAPAP54920 295 aa29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 PRKG1Q13976 671 aa29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 KLHL40Q2TBA0 621 aa29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 SYDE2Q5VT97 1194 aa29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 GALNT17Q6IS24 598 aa29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 M0R2N6 131 aa29.91■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 CLIC4Q9Y696 253 aa29.91■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 STAT2P52630 851 aa29.9■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 BLIDQ8IZY5 108 aa29.9■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 ESYT2A0FGR8 921 aa29.9■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 PLA2G6O60733 806 aa29.9■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 UBE2HP62256 183 aa29.9■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 QRICH1Q2TAL8 776 aa29.9■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 LPAR1Q92633 364 aa29.9■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 COA7Q96BR5 231 aa29.9■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM205CA6NFA0 338 aa29.89■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 POTEIP0CG38 1075 aa29.89■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 POTEJP0CG39 1038 aa29.89■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 ANO1Q5XXA6 986 aa29.89■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 LINC00301Q8NCQ3 95 aa29.89■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 AS3MTQ9HBK9 375 aa29.89■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 PRR12Q9ULL5 1215 aa29.89■■■□□ 2.38
SCAMP4-210ENST00000588555 YEATS4O95619 227 aa29.88■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 SPP2Q13103 211 aa29.88■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 IKQ13123 557 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 MTMR2Q13614 643 aa29.88■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 RILPL1Q5EBL4 403 aa29.88■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF280CQ8ND82 737 aa29.88■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 MAP3K9P80192 1104 aa29.87■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP1R18Q6NYC8 613 aa29.87■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa29.87■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 SMCO2A6NFE2 343 aa29.87■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 MBD3O95983 291 aa29.87■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 VGLL4Q14135 290 aa29.87■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 PGBD1Q96JS3 809 aa29.87■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.87■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 ZHX2Q9Y6X8 837 aa29.87■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 BACE1P56817 501 aa29.86■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 DGKZQ13574 1117 aa29.86■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 CHURC1Q8WUH1 139 aa29.86■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 C6orf50Q9HD87 102 aa29.86■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 GNA11P29992 359 aa29.85■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 USP14P54578 494 aa29.85■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 FEM1BQ9UK73 627 aa29.85■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHA6Q9UN73 950 aa29.85■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa29.85■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 NF2P35240 595 aa29.85■■■□□ 2.37
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