RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588169.5

PGS1-209, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PGS1, Length 1,700 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-209ENST00000588169 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 SH2D4AQ9H788 454 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 KIF28PB7ZC32 967 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 USP17L10C9JJH3 530 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 IRF6O14896 467 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 GJA5P36382 358 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 DGKZQ13574 1117 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 BRAPQ7Z569 592 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 PPIL2Q13356 520 aa22.22■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 WNK4Q96J92 1243 aa22.22■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 USP28Q96RU2 1077 aa22.22■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 BACE1P56817 501 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 FUT2Q10981 343 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-209ENST00000588169 F5H6K3 240 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 HMGCS2P54868 508 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 KLRC3Q07444 240 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 RGMBQ6NW40 437 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 VCPKMTQ9H867 229 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 GOPCQ9HD26 462 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 MYH6P13533 1939 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 CREBZFQ9NS37 354 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 NDUFB10O96000 172 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 SLFN13Q68D06 897 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 PGBD1Q96JS3 809 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 SYCE3A1L190 88 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 PDHBP11177 359 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 KIF5BP33176 963 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 USP14P54578 494 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 SPRYD7Q5W111 196 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 MAP3K14Q99558 947 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 C19orf81C9J6K1 198 aa22.17■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 PKN1Q16512 942 aa22.17■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.17■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 CXCL11O14625 94 aa22.17■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 MMP1P03956 469 aa22.17■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.17■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.141e-7■■■■□ 22.1
PGS1-209ENST00000588169 SLC1A4P43007 532 aa22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 MRE11P49959 708 aa22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 GRM1Q13255 1194 aa22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 GRM4Q14833 912 aa22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 CCDC96Q2M329 555 aa22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.16■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 SLC10A3P09131 477 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 SNHG28P0DPA3 235 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 VCAM1P19320 739 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 HTRA3P83110 453 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 SNAPC2Q13487 334 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 KCTD1Q719H9 257 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 LPAR1Q92633 364 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 GMCL1Q96IK5 515 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 CLIC4Q9Y696 253 aa22.15■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 LIG1P18858 919 aa22.14■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.14■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.14■■□□□ 1.14
PGS1-209ENST00000588169 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms