RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 NBPF11Q86T75 865 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 JAK2O60674 1132 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 PPFIA3O75145 1194 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 SNAPC2Q13487 334 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 PHKBQ93100 1093 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 SMARCA1P28370 1054 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 SLC16A2P36021 539 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 STAT2P52630 851 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 FUT2Q10981 343 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 ZIC5Q96T25 663 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 CYTH3O43739 400 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 GTF2A2P52657 109 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 DDX11Q96FC9 970 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 FEM1BQ9UK73 627 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 PLA2G6O60733 806 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 SLC10A3P09131 477 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 GJB2P29033 226 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 TREML2Q5T2D2 321 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 FAM160B2Q86V87 743 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.2■■□□□ 1.15
CTU2-204ENST00000564105 STK36Q9NRP7 1315 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 CETPP11597 493 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 MOGSQ13724 837 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 CCDC102AQ96A19 550 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 TSKSQ9UJT2 592 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 USP17L15C9J2P7 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 USP17L11C9JVI0 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 USP17L18D6R9N7 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 USP17L22D6RA61 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 USP17L19D6RCP7 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 USP17L20D6RJB6 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 FLOT1O75955 427 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 USP17L24Q0WX57 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 CCL15Q16663 113 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 KIFC2Q96AC6 838 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 TCHHQ07283 1943 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 DEXIO95424 95 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 HOMER1Q86YM7 354 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 PIGSQ96S52 555 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 NOGQ13253 232 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 MTMR8Q96EF0 704 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 KIF3AQ9Y496 699 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-204ENST00000564105 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.142e-12■■□□□ 13.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms