RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	CERS3	Q8IU89	383 aa		20.77	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		20.77	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		20.77	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		20.77	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		20.77	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	20.77	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	KCNJ18	B7U540	433 aa		20.77	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	KCNJ12	Q14500	433 aa		20.77	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	KCNB1	Q14721	858 aa		20.77	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		20.77	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		20.76	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559		M0R2N6	131 aa		20.76	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	20.76	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	STIM1	Q13586	685 aa		20.76	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		20.76	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		20.76	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		20.76	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	TSPY3	P0CV98	308 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	TSPY8	P0CW00	308 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	PPP4C	P60510	307 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	CEP112	Q8N8E3	955 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	LDHC	P07864	332 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	TM4SF1	P30408	202 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	PRPH	P41219	470 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	UBA7	P41226	1012 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	TEX35	Q5T0J7	233 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	VPS16	Q9H269	839 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	CUEDC2	Q9H467	287 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	BARHL2	Q9NY43	387 aa		20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	20.75	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	PRCP	P42785	496 aa		20.74	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	ADSSL1	Q8N142	457 aa		20.74	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		20.74	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	CDC23	Q9UJX2	597 aa		20.74	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		20.74	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		20.74	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		20.74	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		20.74	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		20.74	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	CTAGE9	A4FU28	777 aa		20.73	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMTS3	O15072	1205 aa		20.73	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	GNPAT	O15228	680 aa		20.73	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	KCNQ4	P56696	695 aa		20.73	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	20.73	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	AK8	Q96MA6	479 aa		20.73	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		20.73	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	POTEB2	H3BUK9	544 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	CHMP4BP1	P59074	171 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	THAP9	Q9H5L6	903 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PQC6	194 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	PSMA7	O14818	248 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	UBXN1	Q04323	297 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	JAG2	Q9Y219	1238 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	GDA	Q9Y2T3	454 aa		20.72	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	STXBP3	O00186	592 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	KRT9	P35527	623 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G4A	P47712	749 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC151	A5D8V7	595 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	RHOBTB3	O94955	611 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	CDC25A	P30304	524 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	GRAP	Q13588	217 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	BRD3	Q15059	726 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	INF2	Q27J81	1249 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		20.71	■□□□□ 0.91
RRN3-205	ENST00000563559	MYH8	P13535	1937 aa		20.7	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	USP17L3	A6NCW0	530 aa		20.7	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	USP17L4	A6NCW7	530 aa		20.7	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	LGALS16	A8MUM7	142 aa		20.7	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	ERVK-24	P63145	666 aa		20.7	■□□□□ 0.9

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