RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	PTH1R	Q03431	593 aa		24.65	■■□□□ 1.54
CS-222	ENST00000550996	KCTD1	Q719H9	257 aa		24.65	■■□□□ 1.54
CS-222	ENST00000550996	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		24.65	■■□□□ 1.54
CS-222	ENST00000550996	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	24.65	■■□□□ 1.54
CS-222	ENST00000550996	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		24.65	■■□□□ 1.54
CS-222	ENST00000550996	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	24.65	■■□□□ 1.54
CS-222	ENST00000550996	LAMA4	Q16363	1823 aa		24.65	■■□□□ 1.54
CS-222	ENST00000550996	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		24.65	■■□□□ 1.54
CS-222	ENST00000550996	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	24.64	■■□□□ 1.54
CS-222	ENST00000550996	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		24.64	■■□□□ 1.54
CS-222	ENST00000550996	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		24.64	■■□□□ 1.54
CS-222	ENST00000550996	MTMR7	Q9Y216	660 aa		24.64	■■□□□ 1.54
CS-222	ENST00000550996	ATP2A1	O14983	1001 aa		24.63	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	SGSM2	O43147	1006 aa		24.63	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	24.63	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	24.63	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	24.63	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	CEP290	O15078	2479 aa		24.62	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996		B4E1Z4	1266 aa		24.62	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	FCER1A	P12319	257 aa		24.62	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	CYP2C19	P33261	490 aa		24.62	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	24.62	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	DPP9	Q86TI2	863 aa		24.62	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	CPXCR1	Q8N123	301 aa		24.62	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	ESR2	Q92731	530 aa		24.62	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		24.62	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		24.62	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	24.62	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	ZBED4	O75132	1171 aa		24.61	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	KDM4A	O75164	1064 aa		24.61	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	24.61	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	PGK2	P07205	417 aa		24.61	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	STAT2	P52630	851 aa		24.61	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	TRPV1	Q8NER1	839 aa		24.61	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		24.61	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	MMP19	Q99542	508 aa		24.61	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		24.61	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	PLA2G6	O60733	806 aa		24.6	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	24.6	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		24.6	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		24.6	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		24.6	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	DCAF4	Q8WV16	495 aa		24.6	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	ZNF536	O15090	1300 aa		24.6	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	COPB2	P35606	906 aa		24.59	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	24.59	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	SNAP25	P60880	206 aa		24.59	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	FAM160B2	Q86V87	743 aa		24.59	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	24.59	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		24.59	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	PDHB	P11177	359 aa		24.58	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	24.58	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	CCDC96	Q2M329	555 aa		24.58	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	LHX8	Q68G74	356 aa		24.58	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	MAML3	Q96JK9	1138 aa		24.58	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	TTC14	Q96N46	770 aa		24.58	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		24.58	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		24.58	■■□□□ 1.53
CS-222	ENST00000550996	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	24.58	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	CYP21A2	P08686	494 aa		24.57	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	CYBA	P13498	195 aa		24.57	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	24.57	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	SLC16A2	P36021	539 aa		24.57	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	SLC4A3	P48751	1232 aa		24.57	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	OAZ1	P54368	228 aa		24.57	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	KCTD2	Q14681	263 aa		24.57	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		24.57	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		24.57	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		24.57	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	SNHG28	P0DPA3	235 aa		24.56	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		24.56	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	24.56	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		24.56	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	24.56	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	24.56	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	24.56	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		24.55	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	FDX1	P10109	184 aa		24.55	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	NT5C2	P49902	561 aa		24.55	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		24.55	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	DGKH	Q86XP1	1220 aa		24.55	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	ANKS1A	Q92625	1134 aa		24.55	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		24.55	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	24.55	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		24.55	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		24.55	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	24.55	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	ZNF543	Q08ER8	600 aa		24.54	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		24.54	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	CCDC174	Q6PII3	467 aa		24.54	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		24.54	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	IQCA1	Q86XH1	822 aa		24.54	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	MAP4K1	Q92918	833 aa		24.54	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	24.54	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	KRT23	Q9C075	422 aa		24.54	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		24.54	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		24.54	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	CAPN2	P17655	700 aa		24.53	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		24.53	■■□□□ 1.52
CS-222	ENST00000550996	CHST13	Q8NET6	341 aa		24.53	■■□□□ 1.52

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