RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 FDPSP14324 419 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SLC16A2P36021 539 aa13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 TRIM29Q14134 588 aa13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 TTBK2Q6IQ55 1244 aa13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SAPCD2Q86UD0 394 aa13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 ADGRF4Q8IZF3 695 aa13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 RGS22Q8NE09 1264 aa13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 ALG1Q9BT22 464 aa13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 USP17L15C9J2P7 530 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 USP17L13C9JLJ4 530 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 USP17L11C9JVI0 530 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 USP17L18D6R9N7 530 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 USP17L22D6RA61 530 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 USP17L17D6RBQ6 530 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 USP17L19D6RCP7 530 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 USP17L20D6RJB6 530 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 H3BQV1 296 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 FLOT1O75955 427 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 FDX1P10109 184 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SCG2P13521 617 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 DDIT3P35638 169 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 GJA5P36382 358 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 GTF2A2P52657 109 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 NUCB2P80303 420 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 USP17L24Q0WX57 530 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SLC35G1Q2M3R5 365 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 IFFO2Q5TF58 517 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SPRYD7Q5W111 196 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 RGMBQ6NW40 437 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 GADL1Q6ZQY3 521 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 HOMER1Q86YM7 354 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 MTMR8Q96EF0 704 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 HHIPL1Q96JK4 782 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 C8orf76Q96K31 380 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SLF1Q9BQI6 1058 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 CPVLQ9H3G5 476 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 JMJD4Q9H9V9 463 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 VAT1LQ9HCJ6 419 aa13.84□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 ZBTB5O15062 677 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 DTNBO60941 627 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 CETPP11597 493 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 TRAF1Q13077 416 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 DGKZQ13574 1117 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 PKN1Q16512 942 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 PIBF1Q8WXW3 757 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 KIFC2Q96AC6 838 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 PIGSQ96S52 555 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 CHMP5Q9NZZ3 219 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 PRR12Q9ULL5 1215 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 MYPNQ86TC9 1320 aa13.83□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 STX6O43752 255 aa13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 SYT1P21579 422 aa13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 CCDC148Q8NFR7 591 aa13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 SH3GLB2Q9NR46 395 aa13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 FBXO28Q9NVF7 368 aa13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 PNMA2Q9UL42 364 aa13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 PARP14Q460N5 1801 aa13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 SLC10A3P09131 477 aa13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 COG2Q14746 738 aa13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 QRICH1Q2TAL8 776 aa13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 PPP1R18Q6NYC8 613 aa13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 CCDC102AQ96A19 550 aa13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 AIFM3Q96NN9 605 aa13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 BARHL2Q9NY43 387 aa13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 HOXC10Q9NYD6 342 aa13.81□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 ZBED4O75132 1171 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 OSBPP22059 807 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 DSG3P32926 999 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 FOSBP53539 338 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms