RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa28.62■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 PHF24Q9UPV7 400 aa28.62■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa28.61■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 AKR1A1P14550 325 aa28.61■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 ADCYAP1R1P41586 468 aa28.61■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa28.61■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.61■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 RIPK3Q9Y572 518 aa28.61■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa28.61■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 PRDM1O75626 825 aa28.6■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 PDE4BQ07343 736 aa28.6■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa28.6■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 RNF180Q86T96 592 aa28.6■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa28.6■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 MTMR10Q9NXD2 777 aa28.6■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 FEM1BQ9UK73 627 aa28.6■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 CNPY2Q9Y2B0 182 aa28.6■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 ZBED4O75132 1171 aa28.59■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 OAZ1P54368 228 aa28.59■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 TRIM60Q495X7 471 aa28.59■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 FDX1P10109 184 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 MX1P20591 662 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 Q7L0L9 218 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 DDX11Q96FC9 970 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 FSD1Q9BTV5 496 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 NAPBQ9H115 298 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 PDLIM7Q9NR12 457 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 TSPY3P0CV98 308 aa28.57■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 TSPY8P0CW00 308 aa28.57■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 SLC17A8Q8NDX2 589 aa28.57■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 FBXO40Q9UH90 709 aa28.57■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 POTEB2H3BUK9 544 aa28.56■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 ADAMTS4O75173 837 aa28.56■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 PPARAQ07869 468 aa28.56■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa28.56■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 CHST13Q8NET6 341 aa28.56■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 FERMT2Q96AC1 680 aa28.56■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 KIFC2Q96AC6 838 aa28.56■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 PGK1P00558 417 aa28.55■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 CPXCR1Q8N123 301 aa28.55■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 MCM3APO60318 1980 aa28.55■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 BMP3P12645 472 aa28.54■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 SLFN13Q68D06 897 aa28.54■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 FAM184BQ9ULE4 1060 aa28.54■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 TACC3Q9Y6A5 838 aa28.54■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 A0A0C4DFX4 3053 aa28.54■■■□□ 2.16
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ACER3-211ENST00000531461 A0A1W2PQY0 241 aa28.53■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 TFAP4Q01664 338 aa28.53■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 TLE2Q04725 743 aa28.53■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 GMCL1Q96IK5 515 aa28.53■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 TRIM43BA6NCK2 446 aa28.52■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 FOXP2O15409 715 aa28.52■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 KLHDC9Q8NEP7 349 aa28.52■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 BADQ92934 168 aa28.52■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
ACER3-211ENST00000531461 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.163e-9■■■■□ 23.2
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ACER3-211ENST00000531461 MOXD2PA6NHM9 499 aa28.51■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 PLA2G6O60733 806 aa28.51■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 STAT2P52630 851 aa28.51■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa28.51■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 FAM160B2Q86V87 743 aa28.51■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 ANKRD35Q8N283 1001 aa28.51■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 FGD4Q96M96 766 aa28.51■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa28.51■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 CLTBP09497 229 aa28.5■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 CST5P28325 142 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 TICAM2Q86XR7 235 aa28.5■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 CHURC1Q8WUH1 139 aa28.5■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 NUP133Q8WUM0 1156 aa28.5■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 TOX2Q96NM4 488 aa28.5■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.5■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 TMEM232C9JQI7 657 aa28.49■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 ACVR2BQ13705 512 aa28.49■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 SHHQ15465 462 aa28.49■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa28.49■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 STAG1Q8WVM7 1258 aa28.49■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 EVI5LQ96CN4 794 aa28.49■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
ACER3-211ENST00000531461 KIAA0355O15063 1070 aa28.48■■■□□ 2.15
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