RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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PTPRK-218ENST00000525459 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.8■■□□□ 1.08
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PTPRK-218ENST00000525459 SMARCA1P28370 1054 aa21.79■■□□□ 1.08
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PTPRK-218ENST00000525459 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.79■■□□□ 1.08
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PTPRK-218ENST00000525459 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTPRK-218ENST00000525459 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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PTPRK-218ENST00000525459 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 ATP2A1O14983 1001 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTPRK-218ENST00000525459 MCM2P49736 904 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTPRK-218ENST00000525459 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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PTPRK-218ENST00000525459 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.73■■□□□ 1.07
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PTPRK-218ENST00000525459 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 SLC25A27O95847 323 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 KIF22Q14807 665 aa21.72■■□□□ 1.07
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PTPRK-218ENST00000525459 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.71■■□□□ 1.07
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PTPRK-218ENST00000525459 ICAM1P05362 532 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGEF6Q15052 776 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 MTMR8Q96EF0 704 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 BTBD7Q9P203 1132 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 PCNTO95613 3336 aa21.7■■□□□ 1.07
PTPRK-218ENST00000525459 FKTNO75072 461 aa21.7■■□□□ 1.06
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