RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPN18Q99952 460 aa26.39■■□□□ 1.82
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TSNARE1-208ENST00000524325 VEGFBP49765 207 aa26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 C1QTNF8P60827 252 aa26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB5O15062 677 aa26.29■■□□□ 1.8
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