RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	MAP6	Q96JE9	813 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	SGPP1	Q9BX95	441 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	GINM1	Q9NU53	330 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	NFIB	O00712	420 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM253	P0C7T8	217 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	PDE6B	P35913	854 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	CHRNE	Q04844	493 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	DCAF15	Q66K64	600 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	NRDC	O43847	1150 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	VAV1	P15498	845 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	VAMP1	P23763	118 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	SLC14A2	Q15849	920 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	BRF1	Q92994	677 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	CD320	Q9NPF0	282 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CDK1-208	ENST00000519760	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF205	O95201	554 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	MED14OS	P0DP75	135 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	IMPDH2	P12268	514 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	RTP1	P59025	263 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF445	P59923	1031 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	SNX17	Q15036	470 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	RTP2	Q5QGT7	225 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	ADGRF1	Q5T601	910 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	TM9SF2	Q99805	663 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760		H0Y8X5	98 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	GLDC	P23378	1020 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	GUCY2C	P25092	1073 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	BMP8B	P34820	402 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	KCNA10	Q16322	511 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	FBLN7	Q53RD9	439 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	TOX2	Q96NM4	488 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	GP6	Q9HCN6	339 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	GCM1	Q9NP62	436 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	GSTM1	P09488	218 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	DLG4	P78352	724 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	OR14I1	A6ND48	311 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	PEX10	O60683	326 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	CD247	P20963	164 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	SOX9	P48436	509 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	LINC00310	P59036	64 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	RGS22	Q8NE09	1264 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	GPRASP2	Q96D09	838 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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