RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 FANCBQ8NB91 859 aa12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 MYL10Q9BUA6 226 aa12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 PNMA2Q9UL42 364 aa12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 BRPF3Q9ULD4 1205 aa12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 EVCP57679 992 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CCNA1P78396 465 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 TRAF1Q13077 416 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 BTNL9Q6UXG8 535 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 LBX2Q6XYB7 198 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 JMYQ8N9B5 988 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 KIF2CQ99661 725 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 PAGR1Q9BTK6 254 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CFHR5Q9BXR6 569 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 WBP1LQ9NX94 342 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 MAD2L2Q9UI95 211 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa12.94□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CPLX1O14810 134 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 TBC1D8O95759 1140 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 RXRAP19793 462 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SMARCA1P28370 1054 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SLC16A2P36021 539 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 PLS1Q14651 629 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 KIF22Q14807 665 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 ATG4CQ96DT6 458 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 FBXO28Q9NVF7 368 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 PRR12Q9ULL5 1215 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CEP350Q5VT06 3117 aa12.93□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 VWA5AO00534 786 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CDKL5O76039 1030 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 COPB2P35606 906 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 OAZ1P54368 228 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 STK3Q13188 491 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 ARHGEF6Q15052 776 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 FAM110CQ1W6H9 321 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 TTBK2Q6IQ55 1244 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 RASGRP2Q7LDG7 609 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 ADGRF4Q8IZF3 695 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 STAG2Q8N3U4 1231 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 UBA5Q9GZZ9 404 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 VAT1LQ9HCJ6 419 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CPA4Q9UI42 421 aa12.92□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 ERVK-9P63128 1117 aa12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 ERVK-24P63145 666 aa12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CCT2P78371 535 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 C17orf99Q6UX52 265 aa12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 TMTC3Q6ZXV5 915 aa12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SPZ1Q9BXG8 430 aa12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 TEX13BQ9BXU2 312 aa12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 MORF4L1Q9UBU8 362 aa12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 TPCN1Q9ULQ1 816 aa12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 NID2Q14112 1375 aa12.91□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 GPR25O00155 361 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 PFKFB2O60825 505 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SLC25A27O95847 323 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 STAT3P40763 770 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SLC4A3P48751 1232 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SP3Q02447 781 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CCDC174Q6PII3 467 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 HOMER1Q86YM7 354 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 TRIM22Q8IYM9 498 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CPXCR1Q8N123 301 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SPATC1LQ9H0A9 340 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 RIOX1Q9H6W3 641 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 RBPJLQ9UBG7 517 aa12.9□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 ADGRA2Q96PE1 1338 aa12.89□□□□□ -0.35
ITGA3-210ENST00000507771 ATP2A1O14983 1001 aa12.89□□□□□ -0.35
ITGA3-210ENST00000507771 ZBTB5O15062 677 aa12.89□□□□□ -0.35
ITGA3-210ENST00000507771 FKTNO75072 461 aa12.89□□□□□ -0.35
ITGA3-210ENST00000507771 PLEKHA8P1O95397 391 aa12.89□□□□□ -0.35
ITGA3-210ENST00000507771 ICAM1P05362 532 aa12.89□□□□□ -0.35
ITGA3-210ENST00000507771 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
ITGA3-210ENST00000507771 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
ITGA3-210ENST00000507771 BCRP11274 1271 aa12.89□□□□□ -0.35
ITGA3-210ENST00000507771 MAPK4P31152 587 aa12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms